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三种消毒方式所利用的原理不同。
&酒精消毒，即采用75度乙醇消毒，是利用高浓度的乙醇投入使病毒内部，使其蛋白质变性，细菌病毒死亡 ；酒精易挥发，对人体皮肤和餐具无腐蚀，挥发后残留的微量酒精对人体几乎无危害。
&次氯酸消毒是利用其强氧化性使有机物氧化，细菌病毒死亡；次氯酸使用简便、安全,对人体无刺激性损伤,一般经过稀释后适用于日常喷洒消毒。比如次氯酸钠在水处理领域用作净水剂、消毒剂、杀菌剂;用于工业水和游泳池水的杀菌消毒和灭藻;也用于分解有机物，以及用作去除铁、锰的助剂等。
&紫外线消毒是利用了紫外线光照射到微生物时，便发生能量的传递和积累，积累结果造成微生物的灭活，从而达到消毒的目的。紫外线消毒，适合餐具消毒或手术器具、被褥衣物、浴室厕所消毒。木质、塑料等物品，长时间或经常紫外线照射，也是破坏其中的微生物环境，使其过早老化了。
三种消毒方式各有不足:
&酒精只有配置成75%左右的体积比浓度才会有较强的杀菌效果，但只能杀灭常见毒菌却很难杀灭肝炎病毒!
&次氯酸消毒对于重金属离子类的有毒物质的消毒效果就微乎其微了。另外次氯酸是化学物质，其使用要特别注意，如次氯酸钠是强氧化剂，具有腐蚀性。皮肤接触会引起烧伤。进入人体内会导致粘膜腐蚀、食管或气管穿孔、喉部水肿。
&紫外线照射法，采用的紫外线灯管随使用时间的增加而减退，因此杀菌能力不断减退；紫外线穿透力极弱，有死角，杀菌作用随着菌种不同而不同。紫外线灯工作期间，没有对身体做特殊的防护，那么人体可能会受到巨大的伤害，尤其是眼睛。紫外线会损伤眼睛角膜的上皮细胞，被紫外线灯照射两个小时以上，眼睛就会出现不同程度的眼睛异物感，严重的还会有眼睛刺痛、流泪甚至眼睛痉挛和眼睛模糊等现象。另外含有益菌或微生物的食品不能使用紫外线杀毒，因为杀菌的同时，也破坏了营养成分。
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紫外线消毒是在一定的控制范围内，如室或箱内消毒在空间达到无菌的效果，如手术室，微生物试验接种箱等，酒精是用于人的皮肤或工具消毒，次氯酸是用于所有需要消毒的物品，以浸泡的方式，根椐消毒物品需要的浓度加水配制，如，1比13，1比18等。
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紫外线通过照射，紫外光会使病毒DNA分解，从而杀死病毒，酒精是使病毒脱水死亡，次氯酸是使病毒电解质紊乱并水解而死去…
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