明清之际，杭州城市几乎没有抵抗，就投降了清军，当然也没有大的屠杀。
1645年，南京被清军攻陷，南明弘光帝在逃亡中走散，在今天的南京溧兴区被抓。我特别同情这个大胖子，它有个一袭青衣，以扇遮面的画面，特别凄凉。他父亲福王被李自成军队抓到，与一头鹿炖了被起义军吃了。
5月22日，南明政权实际掌权者著名的反派马士英与邹太后逃到了杭州。此时，潞王朱常汸也在杭州，另一个著名的奸臣也是天才的剧作家阮大铖也在，还有朱大典，总兵方国安等。其实，此时的杭州，汇集了南明政权的最后一手牌。
众臣在逃亡人员中挑选潞王朱常汸监国，监国就是暂代皇帝职位。面对这个掉脑袋的位置，朱常汸苦苦拒绝，后来邹太后一再的流泪相劝，朱常汸勉强接受了。
很快，6月8日，皇位做的惴惴不安的朱常汸听取了马士英的建议，当然也是他自己的迫切希望，派遣陈洪范北上与清军议和。此时的陈洪范其实早已投降了清军。
既然要投降，清军当然可以快马加鞭的南下。6月11日，清军已经到达了离杭州不远的塘栖。一听到清军仅在数十公里开外，阮大铖，朱大典等人立马溃逃，可怜的监国孤独又忐忑的等候清军。
方国安率军在西湖边涌金门与清军激战过一番，战斗之际，朱常汸竟然命人从墙头用绳子给清军送酒肉。心灰意冷的方国安于是领兵退到钱塘江边，后来被清军击溃，逃至钱塘江对岸与清军隔江对峙。清军无意中抓获了一个挑着一担盐过江的人，找到了浅水区，于是从容过江，突然袭击方国安部，方国安溃败。
6月15日，朱常汸命令都督陈洪范、巡抚张秉贞开城门，递降书。博洛贝勒率大军入城。杭州从此由明而成清。
朱常汸终究无法用投降来保住性命，被押解北京，与弘光帝以及其他的朱姓藩王一起关押在京。第二年5月，大清找了一个“谋为不轨”的罪名一起诛杀了。
几年后，旗人开始修筑旗营，从此长期有军队驻扎杭州，直到辛亥革命。
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