克羅地亞獨立戰爭於1991年至1995年在忠於克羅地亞政府的克羅地亞軍隊和塞爾維亞控制的南斯拉夫人民軍（JNA）和當地塞爾維亞軍隊之間展開，直到1992年，克羅地亞軍隊結束了在克羅地亞的戰鬥行動。在克羅地亞，戰爭主要被稱為“本土戰爭”（domovinski rat），也被稱為“更大的塞爾維亞侵略”（velikosrpska agresija）。在塞爾維亞資料來源中，“克羅地亞戰爭”（phiraату諭рватско_/rat u hrvatskoj）和“krajina戰爭”（phiraатуКра_ини/rat u krajini）被使用。
大多數克羅地亞人希望克羅地亞離開南斯拉夫，成為一個主權國家，而許多生活在克羅地亞的塞爾維亞人，在塞爾維亞的支持下，反對分裂國家，並希望塞爾維亞聲稱土地與塞爾維亞處於同一個國家。大多數塞族人實際上在南斯拉夫聯邦內尋求新的塞族國家，包括克羅地亞、波斯尼亞和黑塞哥維那等塞族人佔多數或有重要少數民族的地區，並試圖儘可能多地征服克羅地亞克羅地亞於1991年6月25日宣佈獨立，但同意將其推遲至布里歐。1991年10月8日，NI同意並切斷與南斯拉夫的所有剩餘聯繫。
JNA最初試圖通過佔領克羅地亞的全部領土來保持克羅地亞在南斯拉夫境內的地位，在此之後，塞爾維亞軍隊在克羅地亞境內建立了自稱的塞爾維亞共和國Krajina（RSK）。1992年1月停火和國際承認克羅地亞共和國為主權國家後，前線已確立，聯合國保護部隊（UNFOR）已部署，隨後三年內戰鬥基本上斷斷續續。在這段時間裡，偵察衛星網覆蓋了13913平方公里（5372平方英里），超過了克羅地亞的四分之一。
1995年，克羅地亞發動了兩次重大進攻，稱為“閃電行動”和“風暴行動”，這將有效地結束對其有利的戰爭。到1998年，聯合國東斯拉沃尼亞、巴蘭扎和西西里姆（安提斯）區的過渡當局已和平地重新融入克羅地亞。
這場戰爭以克羅地亞的勝利結束，因為它實現了它在戰爭開始時宣佈的目標：獨立和保護其邊界[12][13]大約21-25%的克羅地亞經濟遭到破壞，估計370億美元的基礎設施受損、產出損失和與難民有關的費用超過2萬人被殺害。戰爭期間，雙方都流離失所。塞爾維亞和克羅地亞政府開始逐步合作，但緊張局勢仍然存在，部分原因是前南斯拉夫國際刑事法庭（ICTY）的裁決和各國對對方提起的訴訟。
2007年，前南斯拉夫國際刑事法庭（ICTY）對克羅地亞塞爾維亞領導人之一米蘭·馬蒂（Milan Marti_）作出有罪判決，指控他與斯洛博丹·米洛·埃維（Slobodan Milo_evi_）等人勾結，建立了一個“統一的塞爾維亞國家”。2008年至2012年，ICTY起訴了克羅地亞將軍安特·戈托維納（Ante Gotovina）、姆亞丁·M。阿卡和伊萬·埃爾馬克涉嫌參與與“暴風行動”有關的犯罪活動。_ermak被徹底宣判無罪，Gotovina和Marka_的判決隨後被一個ICTY上訴小組推翻。國際法院駁回了克羅地亞和塞爾維亞2015年關於種族滅絕的共同主張。法院重申，在某種程度上，針對平民的罪行已經發生，但裁定不存在具體的種族滅絕意圖。
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