第一部，《高达Seed》
故事发生的背景是作为普通人类的自然人和调整者之间沟壑日益加送，最终调整者离开了地球，开始移居到新世代的太空殖民地。组成了军事组织扎夫特，在这里背景下调整者“基拉”突然被卷入战火中，在扎夫特士兵中，基拉发现了好友阿斯兰，之后阿斯兰夺取了圣盾高达，基拉不得不为了保护同伴而出击。字词之后他们的命运也与战争深深牵扯在一起。
动画标题中SEED的含义是将剧中的人类分为两大阵营的遗传基因。
第二部，《钢之炼金术师》
所谓的炼金术，就是以“等价交换”为原则，物质的理解、分解、然后再构筑的这个世界上最先端的科学学术。在炼金术的领域中，最大的“禁忌”就是“人体炼成”。因为思念已故的母亲，失去了一切的年幼的兄弟打破了禁忌。
装着机械铠的，背负着“钢之炼金术士”之名的哥哥，爱德华·艾尔利克，灵魂附着在巨大的铠甲上的弟弟，阿尔方斯·艾尔利克。两人为了夺回失去的东西，开始了寻找“贤者之石”之旅。
随着兄弟两人离“贤者之石”的真相越来越近，也不断地被卷入巨大的阴谋的漩涡之中。
幕后操纵的强大阴谋者的存在。渐渐地露出本性的军事国家亚美斯多利斯受虐的民众的无止尽的憎恨和复仇的意念。炼金术招致的无数悲剧。散在的悲剧最终连成一条线，将人们，民众，甚至国家全部卷入其中。
即使处于绝望和希望的狭缝之中，艾尔利克兄弟依然继续前进。
第三部，《浪客剑心》
故事讲述在幕末年代一位拥有一身绝世剑术的剑客为平乱世，加入改革阵营刺杀敌对阵营首脑，人称“拔刀斋”，杀人无数。维新之后依然收到手持逆刃刀流浪天涯。在东京的神谷道场，剑心遇到了阿薰及一帮朋友们。他是否找到了呢——剑的方向，心的归属。
逆刃之剑，也许是想就这样悄悄的藏住自己的锋芒的，可是剑终归是剑，能够出鞘的剑就更没有理由来说自己已经把自己隐藏得很好。
也许是想避开那些权利的争斗，也许是想避开无谓的纷扰，可是拔刀斋始终是属于那个一开始就被叫做拔刀斋的人，就算有人能够继承，就算别人能够抢去这样的名号，但是人们提起这个名字，脑海里还是一个火红的背影。
第四部，《通灵王》
故事讲述出生在通灵世家的麻仓叶，从小即由爷爷教导成为通灵者，并因和爷爷的一次交谈中得知参加了通灵王大赛并胜出，即能得到精灵王，并可完成自己的任何愿望。从小就希望能够每天轻松听着音乐，过自己喜欢的日子的叶为此而立志，努力成为通灵王……
为寻找持有灵和修炼灵力，叶转学到了踏张之丘。并认识了第一个好友小山田万太，误闯入当地流氓木刀之龙的最佳地点，从而发生冲突，但最后因600年前的武士阿弥陀丸与叶的成功合体，而轻易打败了龙。在叶的帮忙下，阿弥陀丸也了结了600年来的心愿，并愿意成为叶的持有灵，叶的通灵王之路由此展开。
一路上遇见许许多多同伴，连之前发生冲突的木刀之龙都成为通灵者一同比赛。
可没想到最后的BOSS是麻仓叶的孪生兄弟麻仓好，实际上麻仓好为千年前打阴阳师麻仓叶王，转世到今就是为了夺取精灵王，叶将怎么打败这么兄弟呢。。。
第五部，《棋魂》
小学六年级的学生进藤光，无意中跑到爷爷家的阁楼上，发现了一个古棋盘，但是从古棋盘中出现了一个千年前的灵魂，从此附在了光的身上，利用光完成自己下围棋的梦想，光也在对弈的过程中喜欢上了围棋，还遇见了这辈子的好友加宿敌，塔矢亮。塔矢亮盲目追逐着光背后的佐为，光也在追逐着亮。
佐为以为是神让自己领悟神之一手才多次转世，但佐为和塔矢行洋大战后，被光发现了至关重要的一步，才知道他的出现是为了让光看到这盘棋。
第六部，《网球王子》
进入网球名校——青春学园初中部学习的越前龙马，在美国青少年网球大赛上连续四次获胜，被誉为网球天才少年。越前龙马在青春学园网球部中遇到了实力强劲的前辈们，但他以惊人的实力，最终赢得了前辈们的认可正式加入了校队，开始了通往全国大赛的奋斗之路。
第七部，《鬼眼狂刀》
讲述了战国末期,在这乱世之中,有一场决定最后胜负的战争,那就是后人称为关原之战的大对决,嘶杀声如雷鸣般交织怒吼,漫天血雨中,无数的生命消失了… 其中,以剑为生存意义的剑客们,并不在意战争情势的发展,只是为了提高自己的本领,而活在剑的世界中,终以拼斗而之.在那段历史间消失的豪杰中,有一位公认所向无敌的侠客……
第八部，《新世纪福音战士》
神作中的神作，故事剧情描述的是一个有关”第二次冲击”的记事:公元2000年有颗巨大的陨石坠落在南极冰山附近,高温造成部分冰块溶化,连带使得全球水位上涨,接下来的天灾人祸更是连绵不断。
公元2015年又出现了新的入侵者,一种似人的巨大机械战斗群,人们将之称为”使徒”,大概是影射他们是上帝派来的使者,要来消灭作恶多端的人类吧!
人类此刻的各种军事武器对使徒可说是毫无用处,为此,当时地球的政治中心决定重用NERV这个组织,他们以最精密的技术,花费巨资研究出一种以驾驶员的神经直接控制的”泛用人形决战兵器”(EVA),这种高科技产物将驾驶员与机器做了精细的契合,籍由意志及身体的反映来控制EVA.
不过由于当时这些技术还在研发阶段,所以有许多障碍还无法立即克服.而且因为并不是每个人都能自由的驾驶EVA.驾驶人选一直是NERV最头疼的地方,除了符合条件的人难觅,而且还必须经过几个月训练才能和EVA达到同步活动的基本能力.而后，在世界上发现了3名可以驾驶EVA的少男少女，人们把希望都寄托在了他们身上。
第九部，《闪灵二人组》
美堂蛮和天野银次都是拥有特别能力的人。美堂蛮有一双邪眼，他可以让人看到幻像，是让人看到噩梦般的幻像，还是看到幸福的幻像都是因他自己的意志来决定的，此外他还有“SNAKE BITE”这种能力，即是以200KILO的握力把敌人撕裂。而天野银次的能力就是在他的体内潜伏有高压电流，就象是电鳗一样最高可达到10万伏特，不止可以让人类的知觉麻痹，还能破坏电子仪器，用途非常的广泛。
他们拥有这种天赐的能力从事“夺回者”这种工作，不只是说夺取，还为了取回。把委托人被夺走的东西取回来就是他们的工作，但即使有多么特殊的能力，他们做的工作的危险性是很高的，因为他们不是不死的超人，有时他们所付出的努力未必能得到相应的回报，但他们还是继续经营“夺回公司”。所以他们不只为了“夺取”而使用自己的能力，而是为了“取回”而使用的。重要的是为了让某人取回他的笑容。
更重要的是在夺还自己以及朋友的未来，一路上探索、挑战无限城之神的秘密。为了大家的幸福而努力着。
第十部，《最游记》
改编之《西游记》的日本漫画作品。
天地混乱的混沌时代--有一块人和妖怪共存的土地，那里是文明和信仰之源--桃源乡。突然的异变和恐怖袭击了那土地，以往平稳生活着的的妖怪们失去了自我开始了暴走。异变的元凶是“将过去的大妖怪牛魔王给复活了”这件事。
由于在这个世界上被禁忌着的科学和妖术，现在牛魔王的复活要被完成了，负波动覆盖着大地。
看重这事态的天界，下达了请唐三藏去阻止牛魔王复苏实验的命令。同那不怕负波动的三人，孙悟空，沙悟浄，猪八戒一起前往遥远的西天·天竺国的旅行开始了。
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