《新世纪福音战士》中NERV打使徒保护人类，为什么最后会遭到人类攻击？

在《EVA》老剧场版《真心为你》的前半部分中，出现了NERV总部被攻打，伤亡惨重的情节。估计很多观众都有点奇怪，为什么作为人类最后的希望，活跃在抵抗使徒最前线的NERV会被人类进攻呢？

其实这个问题还要从NERV的碇源渡与SEELE的关系说起。碇源渡是个很有野心的人，为了进SEELE的研究所，他不惜做上门女婿，舍弃自己的旧姓“六分仪”也要接近碇唯。这个迷一样的男人经摸爬滚打坐上了NERV司令的位置。

后来碇唯在实验中身亡，碇源渡发现自己竟然深爱着那个女人，于是打算利用莉莉丝重新与老婆见上一面。所以他对待人类补完的态度与SEELE有所不同。

SEELE人类补完的目的是让所有人类回顾莉莉丝，用肉体的死亡换来精神的永生，用个体的逝去来洗刷人类的罪恶。不过碇源渡的想法是“死亡什么都改变不了”，他希望能将亚当的胚胎与莉莉丝融合，从而成为接近“神”的存在。

SEELE和碇源渡之前经历过多次摩擦，之后演化为直接冲突。TV版把渚薰派去NERV搞破坏，算是第一次直接冲突。在《真心为你》中，约定之日即将到来，冲突也再次升级。因为莉莉丝被钉在中央教条区，SEELE无法用她来完成“人类补完计划”，只能抓走初号机作为莉莉丝的替代品。

另一方面，SEELE也不想看到碇源渡抢先完成他的阴谋，于是就欺骗日本政府，说“碇源渡想要引发第三次冲击”，接到情报的部队为了阻止NERV，对它的日本总部发起了大举进攻。但碇源渡也不是吃素的，在此期间NERV一直维持着一级戒备状态，奈何己方以研究人员居多，战斗力实在不行，还是没有逃过被清缴的下场。

总之，人类军队不过是SEELE用来对抗碇源渡的棋子罢了。