《新世紀福音戰士》中NERV打使徒保護人類，為什麼最後會遭到人類攻擊？

在《EVA》老劇場版《真心為你》的前半部分中，出現了NERV總部被攻打，傷亡慘重的情節。估計很多觀眾都有點奇怪，為什麼作為人類最後的希望，活躍在抵抗使徒最前線的NERV會被人類進攻呢？

其實這個問題還要從NERV的碇源渡與SEELE的關係說起。碇源渡是個很有野心的人，為了進SEELE的研究所，他不惜做上門女婿，捨棄自己的舊姓“六分儀”也要接近碇唯。這個迷一樣的男人經摸爬滾打坐上了NERV司令的位置。

後來碇唯在實驗中身亡，碇源渡發現自己竟然深愛著那個女人，於是打算利用莉莉絲重新與老婆見上一面。所以他對待人類補完的態度與SEELE有所不同。

SEELE人類補完的目的是讓所有人類回顧莉莉絲，用肉體的死亡換來精神的永生，用個體的逝去來洗刷人類的罪惡。不過碇源渡的想法是“死亡什麼都改變不了”，他希望能將亞當的胚胎與莉莉絲融合，從而成為接近“神”的存在。

SEELE和碇源渡之前經歷過多次摩擦，之後演化為直接衝突。TV版把渚薰派去NERV搞破壞，算是第一次直接衝突。在《真心為你》中，約定之日即將到來，衝突也再次升級。因為莉莉絲被釘在中央教條區，SEELE無法用她來完成“人類補完計劃”，只能抓走初號機作為莉莉絲的替代品。

另一方面，SEELE也不想看到碇源渡搶先完成他的陰謀，於是就欺騙日本政府，說“碇源渡想要引發第三次衝擊”，接到情報的部隊為了阻止NERV，對它的日本總部發起了大舉進攻。但碇源渡也不是吃素的，在此期間NERV一直維持著一級戒備狀態，奈何己方以研究人員居多，戰鬥力實在不行，還是沒有逃過被清繳的下場。

總之，人類軍隊不過是SEELE用來對抗碇源渡的棋子罷了。