機構改革過程中，涉改單位的組織人員是暫時凍結的，不管是領導幹部任免，還是一般幹部調動，甚至是招考，都是暫時性凍結的。在機構改革期間，違規調整幹部、調動人員，不僅得不能上級組織部門的認可和備案，還會被追究責任，進行黨紀處罰。
隨著黨政機構改革，領導職數會隨編制數額嚴格限制，不得越雷池一步。市縣基層不得成立6名編制以下的機構，不得超職數配備領導，若有超配，或者違規核定領導職數問題，必須於2019年6月底前全面整改完成。按照編制與領導職數的對應關係，人員編制在50名以下的，單位核定一正兩副3名領導職數；人員編制在51—200名的，核定一正三副4名領導職數；人員編制在201—500名的，核定一正四副5名領導職數；人員編制在501—1000名的，核定一正五副6名領導職數；人員編制在1001名以上的，核定一正六副7名領導職數。領導職數只可以按規定核定，可以少核，但嚴禁超核。
機構改革的另一個原則要求是精簡機構，省級黨政機構按60個設置，市縣按規模依次減少，大縣37個，中縣35個，小縣33個，幾乎只有省級黨政機構數額的一半。機構數額減少，領導職數同樣被壓縮。而事業單位改革，以遼寧省7月底結束的試點改革情況來看，省直、市直事業機構減少50%以上，縣區事業單位減少90%以上。機構減少多少，領導職數同樣按比例減少至少3倍以上。例如原來某縣事業單位200個，事業單位領導800人，機構改革後單位數額只有20個，事業單位領導減少到100個左右。
原來的領導人員，隨職位和管理崗位減少，不能擔任實職，或者擔任非領導職務，或者免除職務，只享受原有級別待遇。在改革後一段時期內，行政、事業單位職務晉升機會大大減少，只是解決改革遺留問題，都需要一個漫長的過程。
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