我们所要介绍的是十八界的运作，现在先来谈无余依涅槃的修证，主要是在五蕴、十二处、十八界上面来说。五蕴是色、受、想、行、识；十二处是六根与六尘；六根与六尘相触，就产生了六种的入，也就是色、声、香、味、触、法进入我们的心中；这六尘、六入就会产生六识出现。六根、六尘、六识合为十八界。在《阿含经》四大部中，佛说这十八界法、十二处法，五蕴的法、六入的法都是虚妄性；在小乘法中，佛所说的是十八界空相（不是空性）。为什么讲空相？因为这十八界法都是无常生灭之法，它不是永恒不坏的法，所以叫作无常；无常所以是苦，无常所以是空，无常、苦、空所以是无我，因为它只有一生就坏掉了。十八界当中只有一个意根是可以去到未来世的，其余十七界都是虚妄幻灭的法，只有一生；而这个意根却又不是自然而有，祂是由我们的第八识所生出的，所以在《阿含经》里面，佛说这第八识叫阿赖耶识，这是涅槃的本际。
再谈众生的十八界，可从日常生活中吃饭、走路、思考、回忆，就已函盖十八界法；推而广之，众生日常生活当中，任一作息悉皆如是，三界有情都是不离十八界法。若有深入观行者，又可观察出当前五识中任一识生起时，意识必定俱起；可见意识所缘的境界，乃是非常广大深细，因此使得凡夫众生会把意识当作常恒不灭的心。宗喀巴师徒及一切喇嘛们，却都不知意识的各种变相，也都不知一切意识的生灭无常性，不知一切意识的依他起性，所以错认意识为真实我。
若对十八界有深入观察者，又从中可知众生见闻觉知一向都只在自己内相分上运作，无始以来从未接触外六尘境；而众生颠倒，不知自己所见、所闻、所嗅、所尝、所触、所知诸法，都是自心如来藏变现出来的内相分境界，误以为是接触到真实的外六尘境界，但其实都是自己游戏于自己如来藏变生的内相分中罢了。
又从中可知意根是从无始劫来直至今日都不曾断灭，恒时审度而处处作主，可造善恶业，可堕三恶道，也可修道成佛；但是意根的分别慧极低劣，只能依赖六识的分别来作为取舍的依据；而六识虽能细分别六尘，却又必须依靠意根的引出与作意才能运作，又在意根的主宰下继续造业。
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