二、創建的條件不同。農業合作社只要符合五個組成成員、有辦公場所、達到經營規模等就可以向工商部門申請。農機合作社一般都有國家政策扶持，在黑龍江綏稜這裡申請千萬元農機合作社，國家補貼600萬元，但創建的條件是必須以種植業合作社作為主體才能申請。
三、經營的側重點不同。農業合作社可以是種植、可以是養殖，多以種植、養殖、種植+養殖、種植+加工、種植+養殖+加工等各種形式進行經營。而農機合作社則多以種植為基礎，在以農機服務為主要業務，在滿足本合作社土地農機作業同時，還對外開展代耕、代種、代收，以及土地託管等服務。
當然，農業合作社和農機合作社也有一定相同之處，比如經營機制、利益分配、風險防控等方面基本相同。以上為個人見解，難免偏頗僅供參考。
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