寧夏解放後，人民解放軍第65軍留駐寧夏執行剿匪等任務，軍機關兼寧夏軍區機關。當時，潰散各地的國民黨軍馬鴻逵殘部與土匪等勢力相互勾結，形成了以馬紹武、王敬武、張海祿、郭栓子等為首的十幾股土匪，約2000人。
1950年5月底，人民解放軍寧夏軍區決定，建立統一的剿匪指揮部，而後集中兵力對各股土匪進行圍剿。參戰部隊有第65軍第193、第194、第195師，軍區獨立第1師、騎兵第6師，分別向匪情嚴重的賀蘭山、平羅、同心、惠農、磴口、寧朔、永寧等地區進剿。
在剿匪部隊強大的軍事打擊和政治攻勢下，大多數股匪迅速土崩瓦解。到6月底，寧夏公開活動的股匪只剩下郭栓子、張海祿等部，並竄入賀蘭山區。7月初，寧夏軍區重新調整作戰部署，對賀蘭山殘匪大舉進剿。
9月10日，第65軍抽調第193、第194、第195師各一部，共8個營、2個騎兵連，分多路向賀蘭山進軍。剿匪部隊採用山裡山外結合，控制主要山口、道路，分片分段搜索等方法，對股匪進行嚴密的搜剿合圍。同時，廣泛發動群眾，斷絕土匪糧源，開展瓦解工作。經過近1個月的進剿，股匪的活動範圍逐漸縮小，處境極為孤立。
10月6日，第195師第584團2個連在平羅縣西峰口生擒匪首郭栓子，將股匪主要骨幹分子一網打盡。其餘流散土匪見大勢已去，紛紛投降自首。至10月中旬，寧夏地區十幾股土匪全部被解放軍肅清，共斃傷俘土匪1930餘人，繳獲各種槍894支。剿匪鬥爭的勝利，鞏固了寧夏各級地方政權，安定了社會秩序。
南部山區剿匪；
1949年9月26日，寧夏解放，結束了馬鴻逵集團在寧夏的黑暗統治。然而，寧夏的一小撮反動軍官、潛伏特務、慣匪等暗中串聯，秘密勾結，組成數十股武裝土匪，據佔險山要隘，切斷交通，搶劫財物，殺害地方幹部，襲擊部隊，策劃武裝叛亂，氣焰十分囂張。
其中以馬紹武為首的“仁義軍”200餘人盤踞寧夏同心縣高崖子西南的五當山（又稱廟山），自稱“小臺灣”，公開反共，與人民解放軍對抗。原國民黨馬家軍軍官、匪首張海祿也率匪隊竄到同心、海原一帶，糾集潰逃的國民黨軍散兵遊勇，並與海原慣匪李彥良、楊伯義合併，共200餘人，號稱500餘眾，編為1個團，張海祿自封團長。
1950年1月25日，人民解放軍寧夏軍區獨立第1師獲悉馬紹武股匪正在五當山集結，立即派出第1團和騎兵連，連夜從靈武出發，避開大路，沿小路奔襲，於翌日拂曉趕到豫旺地區，隱蔽休息。
夜間繼續前進，兩夜奔襲200餘里，於28日拂曉到達五當山附近，將土匪據點包圍。激戰3個多小時，殲滅土匪一部，受傷的馬紹武率殘匪逃竄。剿匪部隊窮追不捨。連續追擊7晝夜，日行百餘里。農曆臘月二十四，剿匪部隊在同心川口地區一個破窯洞生擒匪首馬紹武、李成富。到3月上旬，同心地區的馬紹武股匪基本肅清。
為爭取更多的土匪投降，剿匪部隊將匪首李成富釋放。但李成富投奔張海祿，繼續為非作歹。不久，剿匪部隊第二次活捉李匪。在李再三表示痛改前非後，部隊再次將李釋放。但李又上山為匪。第3天夜，剿匪部隊在一位阿訇的幫助下，採用聲東擊西戰術，在李匪的姘婦家將李匪抓獲。經上級批准和軍事法庭宣判，將李匪處決。
1950年3月7日，人民解放軍寧夏軍區派出獨立第1師 第1團、第3團及騎兵第6師一部，由同心城、金集出發，對盤踞於惠安堡、麻黃溝一帶的張廷芝匪部進行圍剿。以慣匪張廷芝為首的股匪200餘人，經常在環縣、吳忠、銀川的公路上及附近地區攔截客商，打家劫舍，危害甚大。剿匪部隊攻佔土匪巢穴後，對逃竄的土匪連續追擊5晝夜，將其包圍於太陽山。除匪首張廷芝帶30餘匪漏網外，近200名匪徒全部被殲滅。
1950年6月12日黃昏，人民解放軍寧夏軍區獨立第1師獲悉張海祿匪幫在海原西山窯鄉搶劫殺人，立即派出騎兵、步兵共4個連前往進剿，但不幸撲空。14日，張匪在黃谷川一帶活動。黃谷川位於寧夏南部山區，是張海祿為首的“仁義軍”在海原、同心等地區的主要據點。
獨立1師集中騎兵、步兵9個連的兵力，分4路進擊黃谷川，但再次撲空。獨立1師遂由參謀長帶領4個連跟蹤追擊，從海原興仁堡追到甘肅靖遠、打拉池，後又追回海原，歷時8天8夜，行程千里，殲滅土匪一部，將張海祿股匪追回老巢——海原黃谷川。
面對解放軍的軍事壓力和政治攻勢，許多土匪紛紛投降，但張匪等頑固不化。剿匪部隊遂將黃谷川嚴密包圍，並逐漸縮小包圍圈，終於通過一給張匪送乾糧的小孩發現張匪的藏身之處，將張海祿等8名土匪全部活捉，並肅清殘匪。至7月底，剿匪部隊在寧夏南部山區共殲滅馬紹武、李成富、張海祿3股土匪，殲滅土匪約200餘人，其中擊斃擊傷匪首14名，活捉匪首69名，有64名匪首投降。至此，寧夏南部山區的股匪被解放軍全部剿滅。
西海固剿匪；
1950年5月上旬，以馬保元等為首的土匪1000餘人，策應平涼地區的土匪，舉行武裝暴亂，襲擊解放軍和當地人民政府。人民解放軍西北軍區為平息匪亂，於5月18日派出騎兵第2旅、回民騎兵團、警備第2團1個營向鄉西海固地區進剿。剿匪部隊採取分進合擊戰術，經10多次作戰，殲匪900餘人。馬保元走投無路向解放軍投降。戰鬥至6月底結束。
石嘴山剿匪；
1950年，惠農縣（今石嘴山市）剛解放不久，慣匪出身的賀蘭保安大隊（由地方起義部隊改編）大隊長郭永勝（郭栓子）先是歸順人民政權，後於3月初發動叛亂，上山重新為匪。郭栓子在22歲時即已為匪，並逐漸成為匪首，佔據賀蘭山，搶掠姦淫，殺人放火，無惡不作。
1934年，官府在屢次剿擊收效甚微後，招降郭匪股，任命郭為平羅縣保安大隊大隊長。1937年，平羅縣保安大隊改編為獨立營，郭任營長。1938年，郭調任平惠賀蘭保安司令，直至1949年解放。
1950年3月4日，郭栓子以帶隊開荒種田的名義，將自己挑選的58人的隊伍開到西山坡米家沙窩，然後向隊伍宣佈發動叛亂。爾後，叛亂隊伍向賀蘭山進發。當夜，行至艽菜溝。5日，抵達黃草灘宿營，郭在此召開會議，研究編制、行動計劃，決定成立“西北反蘇討共寧夏軍區司令部”，郭自任司令，下設3個大隊。
7日晚，匪隊分兩股開始行動，擴大隊伍，搶奪武器，籌集給養。郭親率第一、第三大隊襲擊大武口光華瓷廠（今石嘴山瓷廠），綁架並殺害廠軍代表兼廠長、主任等3人，搶劫錢、糧。隨後，又搶劫汝箕溝煤礦。之後，郭匪聯絡多股土匪，在平、惠、賀一帶組織土匪武裝，收羅槍支彈藥，配合郭匪行動，並準備襲擊經濟、軍事重鎮黃渠橋。
郭栓子發動叛亂後，中共惠農縣委和駐軍對叛匪採取“以政治爭取為主，以軍事剿擊為輔”的方針，分化、瓦解了部分土匪。但郭和大部土匪頑固不化，燒殺搶掠更甚。17日夜，各股土匪分四路緊逼黃渠橋，並由一較大股匪包圍駐軍營地。由於區政府和駐軍有所準備，土匪的圍擊未能成功，但其匪勢、影響擴大，土匪一度發展到300餘人，匪焰更加囂張。
下旬，土匪在侯家嘴大武山襲擊駐軍教導隊，又在玉泉溝襲擊為剿匪前線部隊送給養的後勤分隊，在平羅襲擊5區機關等單位，殺害幹部多人。郭還派人聯絡土匪，企圖配合5月11日的“銀川暴動”。隨著實力的不斷擴大，郭將自己的武裝改稱“賀蘭山黑虎軍”，自任司令。1950年6月10日，郭率匪眾200餘人，攻打左旗，佔領廣播電臺，挾持臺長等人。7月3日，土匪又將左旗旗委書記曹動之和隨行的1名通信員殺害。
鑑於土匪的反動立場，人民政府和駐軍將剿匪的方針，調整為“以軍事剿擊為主，以政治爭取為輔”，除駐軍194師582團外，193師再派出一部參加剿匪。經幾次圍剿，匪夥大部潰散。到7月底，郭栓子及殘部被剿匪部隊壓縮在松山一帶。
8月11日，剿匪部隊在松山圍擊郭匪殘部，殲滅大部。一部分土匪棄郭自逃，郭帶20餘匪先向北逃，遭遇堵截，又返身南逃，並與另一股北逃的土匪合為一股共50餘人，繼續頑抗。剿匪部隊發起攻擊，擊斃殘匪大部，最後將幾個匪首逼進西福溝一個山洞內，並於9月20日和24日將洞內的匪首郭栓子等全部活捉。
1950年11月9日，郭栓子等4名匪首在銀川被公判，處以死刑。在之後的“鎮反”運動中，至1951年5月底，人民政府先後捕獲最大惡極的土匪300餘人。是年7月底，在押土匪被處死17人，判處無期徒刑4人，有期徒刑4人。至此，寧夏境內殘匪基本肅清。
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