清朝末年，國政衰敗，多貪官汙吏。而當時潮汕的某些地主修築城堡，佔領田產，官府也禁止不了。並且時常發生宗族械鬥，嚴重影響農業生產和商貿往來。咸豐三年，外砂王厝村一個叫王興順的人，受到天平天國影響，率領農民起義反清。官府發兵圍剿，王興順寡不敵眾，遠走海外。
到同治九年的時候，潮州總兵方耀用鐵血手腕，搗毀了一個又一個村落的堡壘，以嚴刑峻法來恢復社會秩序。數年間，結積案千餘起，悉數均經嚴治，並無漏網。被絞殺者，有罪有應得，也有無辜錯殺者，導致不少外砂人背井離鄉。
方耀自知清鄉激起了民怨，但他也懂“民以教化”為本，因此他在潮屬各地新設和復辦鄉校數百所，其中一所名為蓬沙書院。其建造規模為澄海明清七書院之首，也是潮汕地區目前保存最完整、面積最大的書院。
蓬沙書院始建於同治九年，同治十三年宣告落成。書院坐東南，向西北，是潮汕傳統民居的四進“雙佩劍”格局，佔地面積2046平方米。門樓為三山門二疊歇山頂建築，大門“蓬沙書院”連同左右山門“同德祠”的題字，是清代書法名家鍾德詳手跡。書齋式建築，穿鬥式樑架結構，中堂為硬山頂，內塑方耀披甲坐像。
一直作為外砂“文祠”的的蓬沙書院，延續到民國時期。大革命時，書院曾作為農會會所。1938年9月，外砂青年抗敵同志會成立，會址設在蓬沙書院。建國後，書院成為外砂人民政府所在地，知道1987年，政府搬出，又改作鎮文化中心。
2012年10月，被確定為廣東省文物保護中心。分享到:
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