新世纪福音战士的就旧剧场版早就在1997年日本电影院公映，而漫画版的完结却是要到2014年才姗姗来迟，这个时间新世纪eva的新剧场版都已经上映了两部，也可以这样理解难怪eva在日本始终是风头不减毕竟每一年都会有相关的新作品出现，始终保持着一定的曝光度。
这里就没有新剧场版的事儿了，毕竟从第二部的结尾开始就已经和原来的TV版沾不上边了，漫画版和原来的TV版大结局（也就是电影版air/真心为你）的结局在最后是有不小的差别，可以说漫画版更符合大团圆结局的思路，而电影版则是显得更加悲凉。
漫画版和电影版最主要的不同就在于明日香和二号机觉醒后单挑eva量产机开始，电影版中初号机是赶不上时间这时候二号机已经被eva量产机完全的拆解，真治随机陷入了换乱被量产机直接托上上空变成了生命之树的形态。而漫画版eva初号机则赶上在二号句被打败之前出现，虽然最后初号机还是被量产机生擒但至少二号机没有被拆解。
之后的剧情漫画要比电影版多更多的细节，碇源渡把亚当的胚胎融入到自己的手中却被绫波丽给拒绝了而且还夺走了亚当，最后被律子射杀。在所有人的灵魂都回归到黑之卵的时候，明日香看到了加持先生也被一并带回去这里就和电影版不同，而碇源渡并没有给回归一直保持着死时的状态，或许是因为将死时与碇唯相遇灵魂也一并融入到初号机的缘故。
而最后碇真治还是选择让世界重新回归到原始状态，这就是对整个地球的重启。画面一转虽然人物还是那一些但是这已经是一个崭新的世界所有人都从毁灭再重新走过来。这里描写的或许就是电影版结局之后的世界一个从毁灭到再生的世界，只是漫画版把时间往后拉而电影版则是直接描写第三次冲击之后的实况。
虽然貌似是大团圆结局的漫画版其实只是人类在第三次冲击之后的延伸，随处可见的量产机已经成为了遗迹，世界即使恢复到当初的模样也已经是新的世界，唯独就只有成为永恒的初号机带着真治父母的灵魂一直在观察着真治所在的这个世界。
而作为碇唯学妹的真希波则在碇唯的回忆中出现，可见真希波其实已经是哦巴桑的年纪只是由于eva的诅咒而一直保持16岁的状态。
可以说漫画版与电影版结局几乎一样都是人类全体回归到起源之中，只漫画版要比电影版来得更多细节而已。
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