导读：对于公司注销未认证的发票如何处理的问题，国家税务总局已作出相关的规定，未认证的发票不予以退税，文中已作出详细的说明，更多内容详情请跟着小编一起来看看吧。
公司注销未认证的发票如何处理?
国家税务总局《关于印发〈增值税问题解答〉的通知》规定，对纳税人倒闭、破产、解散、停业后销售的货物，应按现行税法的规定征税。对纳税人期初存货中尚未抵扣的已征税款，以及征税后出现的进项税额大于销项税额后不足抵扣部分，税务机关不再退税。
根据《财政部国家税务总局关于增值税若干政策的通知》(财税[2005]165号)第六条规定，一般纳税人注销或被取消辅导期一般纳税人资格，转为小规模纳税人时，其存货不作进项税额转出处理，其留抵税额也不予以退税。因此，贵公司注销时留抵的增值税进项税额不予以退税。
根据《中华人民共和国企业所得税法》第八条和《中华人民共和国企业所得税法实施条例》第三十一条的规定，企业发生的除企业所得税和允许抵扣的增值税以外的各项税金及其附加，准予在计算应纳税所得额时扣除。虽然一般纳税人注销时留抵的增值税进项税额不予以退税，但在计算应纳税所得额时是准予扣除的。
已认证发票被作废怎么办?
销货方对于作废的情况及后续抄报税及申报的处理不同，购货方也有所不同：
1、如销货方开出发票后，手工在增值税专用发票记账联票面上写了“作废”字样，而防伪税控开票系统中没有作废的操作，且销货方按正常票进行抄税和申报的，购货方取得的发票抵扣联可正常认证抵扣;
2、如销货方开出发票后，在防伪税控开票系统中作“作废”操作，但已通过人工补录后抄报税和通过国税机关门前受理申报并经异常处理的，购货方取得的发票抵扣联可正常认证抵扣;
3、如销货方开出发票后，在防伪税控开票系统中作“作废”操作，且在抄报税和申报时按“作废”票处理的，购货方取得的发票抵扣联已认证的，不得抵扣进项税，也不得退回开票方;
4、如购货方已抵扣进项的，须转出相应进项。由于具体操作涉及销货和购货双方，具体办理时购货方未必能准确了解开票方及开票方主管国税机关的相关操作，故建议出现此类问题时，应将具体情况向主管国税机关反映，由主管国税机关协助核实开票方相关情况后再予处理。
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