介觀商務模式的提出不僅發現了企業管理理論研究的新視角，為企業管理研究提供了新的獨立分析單元，也對研究方法提出了新的挑戰。新的概念體系需要新的科學方法論和分析工具。將在借鑑自然科學和社會科學研究方法的基礎上，根據介觀商務模式的概念框架，應用適當的理論和形式化的分析工具，研究商務模式創新的內在規律。因此，把介觀商務模式的研究視角和其特有的方法論有機地結合起來，期望在研究問題和方法上取得以下幾個方面的創新。
（1）根據介觀商務模式及其創新的概念體系和基本思想，分析商務模式各組分之間的相互作用關係，進而剖析商務模式作為一個複雜系統的形成機理，分析商務模式的複雜系統特性，探討描述商務模式複雜性的形式化方法，從而為應用複雜系統理論及其有關方法和工具，研究商務模式創新奠定方法論的基礎。
（2）根據商務模式組分及其相互作用關係的特點，探討複雜系統理論的相關研究方法在商務模式創新研究中應用的可能性和具體方法，建立基於複雜系統理論的商務模式創新的基本分析框架。
（3）根據研究的需要和商務模式的複雜系統特性，對複雜系統理論等相關方法和模型做適當改進，建立基於複雜系統理論的商務模式創新模型，進而對模型進行解析分析或計算機模擬。在大量統計結果的基礎上，分析商務模式性能與商務模式複雜性之間的關係，為商務模式創新規律的分析提供形式化和定量的依據。
（4）細分創新的傳統內涵，把商務模式創新獨立於技術創新，視商務模式為最大限度地挖掘技術創新的商業潛力的轉化機制和橋樑，研究商務模式創新與技術創新的協同問題，建立商務模式創新與技術創新的協同模型，用形式化和定量分析的方法，分析商務模式創新與技術創新的必要性和可能性。
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