近代以来，自晚晴开始直到民国时期都有废除中医的议论。
大约从1998年开始，方舟子就开始在网上批评中医，他管理的网站还专门为此设有专栏，收录了数百篇文章。他的观点是：中医理论体系不是科学，与现代科学思想、方法、理论体系格格不入，应该彻底否定、抛弃。对于中医应该“废医验药”，即废除基于阴阳五行、经脉气血的中医理论，将本来用于证实中医的经络、气血等理论的研究经费，转而用科学的方法检验中医的有效性和毒副作用。
著名院士何祚麻也讲，陈晓旭就是被中医害死的，中医90%是糟粕，10%是精华！关于中医的争论反应了中西方古今文化的冲突。反对中医一方站在西方文化和现代主义的立场上，支持中医的另一方则更为强调中国传统文化的价值和意义。
实际上，早在20世纪的民国时期，西医界称中医为“旧医”，称自己是“新医”，将这场医学之争称为“新旧之争”，这已经清楚说明了传统主义和现代主义各自的立场。反对者和支持者内部也有很大的差别，而且对待中医的反对和支持力度都有差别。
这场争论涉及一些复杂的问题，比如科学的标准是什么？如何理解学术的价值？如何制定国家的医学政策？有些问题专业化程度很高，大家也可以思考。
为什么对中医的争论就没有停止过？归根结底，就是以下两个问题：
中医有用吗？
有用。中医的确能治病！
那中药有问题吗？
有问题。而且问题很大！
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