轻症手足口病患者和伴有无菌性脑膜炎患者可完全康复。伴有脑干脑炎、急性弛缓性麻痹、肺水肿、肺出血、心肺功能衰竭并发症的重症患者可能会遗留肢体无力、肌肉萎缩、小脑功能障碍、神经发育迟缓、吞咽困难等后遗症，极少数危重患者救治不及时可能出现死亡。
目前预防手足口病的疫苗只有针对肠道病毒71型（EV71）的单价疫苗，EV71疫苗是由我国自主研发，是目前全球唯一上市可用的疫苗。针对其他肠道病毒血清型的疫苗尚在研发中。
EV71疫苗能预防所有手足口病吗？
目前上市的EV71疫苗可有效预防EV71相关手足口病和EV71感染引起的其他疾病（如疱疹性咽峡炎），但不能预防其他肠道病毒血清型（非EV71）引起的手足口病。EV71是导致手足口病重症和死亡病例的主要病原，该疫苗虽然不能预防所有手足口病，但将会显著减少手足口病重症和死亡的发生。
为什么EV71疫苗不能预防所有手足口病？
肠道病毒是引起手足口病的病原体。至少20多种A组肠道病毒血清型可引起手足口病，以肠道病毒71型（EV71）、柯萨奇病毒A16型（CV-A16）、柯萨奇病毒A6型（CV-A6）、柯萨奇病毒A10型（CV-A10）最为常见，其中重症和死亡多数由EV-A71感染所致。
因此，首先研制的预防疫苗是主要针对肠道病毒71型（EV71）的。
哪些人需要接种EV71疫苗？
EV71疫苗适龄儿童为6月龄-5岁儿童，鼓励在12 月龄前完成接种程序，1岁及以上儿童越早接种越好。对于5岁以上儿童和成人，多数已通过自然感染获得免疫，一般不再推荐接种EV71疫苗。
接种EV71疫苗后还可能得手足口病吗？
儿童接种EV71疫苗后，再得EV71感染所致手足口病的几率很低，但仍有可能出现因感染非EV71的其他肠道病毒血清型而患手足口病。
得过手足口病的适龄儿童是否需要接种EV71疫苗？
如既往手足口病是由EV71引起的，无需再接种EV71疫苗。如果所患手足口病是由其他肠道病毒血清型感染所致，或无病原学诊断结果，可以接种EV71疫苗。
注意，目前EV71疫苗还不是免费接种，需要家长自费、自愿选择接种。
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