公元1368年，明洪武元年，元至正二十八年，在遼闊的中國大地上出現了兩個正統皇帝。這就是明太祖朱元璋與元順帝妥懽帖睦爾，蒙古貴族對中華大地的統治已經進入倒計時狀態。
元順帝
元朝雖然滅亡了，但是蒙古貴族仍然佔據著大漠南北、東北、西北的遼闊地區。在陝西、甘肅、山西、河北北部、雲南仍然存在著大量終於元朝的軍隊。西北的察合臺諸汗國、東北的諸王、高麗仍然在支持元朝皇室。作為蒙古帝國存在的政治實體，仍然具有非常強大的力量。
元順帝妥懽帖睦爾在上都恢復了完整的統治機構，依然作為蒙古汗國的大汗統治著蒙古世界。甚至有重新奪取大都、恢復統治全中國的打算。
明太祖朱元璋深知北元的軍事威脅，調集數十萬精銳部隊，集合徐達、常遇春、李文忠、馮勝、藍玉等名將，雙方為了爭奪全中國的統治權，中國的北方展開了一場曠日持久的戰爭。
王保保
北元名將王保保（擴廓帖木兒）駐紮山西，李思齊等人屯兵山西，總兵力二十餘萬。這些軍隊是元朝最具戰鬥力的部隊，王保保是元末明初最傑出的軍事家之一。徐達與常遇春乘王保保大軍進攻大都時，突然襲擊其老巢太原城。王保保急忙率軍回救，在太原城外與明軍決戰，因部將投降明朝為內應，徐達與常遇春夜襲王保保大營，大獲全勝。一代名將王保保僅率領18騎逃亡。
王保保收集敗兵退居甘肅定西，在沈兒峪一代修整。徐達攻破甘肅慶陽之後，返回南京。王保保趁此機會包圍蘭州全殲明朝援軍，但未能攻破蘭州城。為了消除王保保的威脅，朱元璋派徐達率軍在沈兒峪與王保保對壘，俘獲八萬餘人，王保保逃往和林。
1370年，元順帝妥懽帖睦爾在應昌去世，他是成吉思汗的子孫中，最後一個統治過全中國的大汗。其子愛猷識理達臘繼位，就是北元昭宗。
徐達
洪武十一年，公元1378年，北元昭宗去世，其子脫古思帖木兒繼位。朱元璋希望改善關係，派人前往弔祭北元昭宗，但北元依舊不斷派兵襲擊內地。
王保保去世之後，北元境內最強大的勢力就數東北的納哈出。洪武二十年，馮勝、藍玉率軍出征納哈出。在部將不斷投降的情況下，納哈出不得不派人前往馮勝大營投降。此後北元勢力大為衰落。
藍玉
朱元璋乘勝追擊，命令藍玉作為統帥，率十五萬大軍直搗脫古思帖木兒的大營。藍玉大軍在捕魚兒海追上逃跑的脫古思帖木兒，當時飛沙走石，大軍偷襲成功，斬殺數千人，俘獲脫古思帖木兒的兒子、嬪妃、諸王、大臣，部落七萬餘人。脫古思帖木兒與長子逃脫，在逃亡途中，父子二人被下屬殺害。
脫古思帖木兒死後，蒙古汗國失去了共主，草原之上又陷入了互相攻伐的狀態。成吉思汗的子孫終於告別了那一段榮光無限的歷史，蒙古世界徹底破碎了。
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