故事主人公素媛是一个平凡的小女孩，生活在一个并不富裕的家庭 ，妈妈经营着一家杂货店，杂货店的名字就叫素媛，爸爸是一位工厂普通工人。电影开始在那个飘雨的早上，素媛打着雨伞独自一人去上学，走到离学校几百米的地方，遇到了一个相貌猥琐，头发散乱，酒气冲天的大叔。素媛被猥琐大叔糟蹋了，由此开启了素媛的悲剧之旅，素媛被糟蹋之后自己报了警，被发现时她已经奄奄一息，全身是伤。由于猥琐大叔的残忍手段，素媛做了人工肛门手术，才脱离了危险。
遇到猥琐大叔
手术完后，素媛第一次醒来，坚持告诉爸爸坏人的特征，受到严重创伤的素媛还担心猥琐大叔危害学校同学，和爸爸说：”一定要抓住坏人“。警察现场查出了嫌疑犯的指纹，但是由于没有确凿的证据，没有下令逮捕嫌疑犯，需要受害本人陈述事情经过，并且当场指认嫌疑人，才能下令紧急逮捕。素媛的爸爸一心想抓住猥琐大叔，脑袋混乱，尽然同意了让素媛陈述， 这时素媛的妈妈很不情愿，难道还让素媛再次回忆那段噩梦吗？她还是一个孩子，你想过孩子的感受吗？
被糟蹋后的素媛
爸爸还是坚持让素媛陈述，最后素媛陈述了事情经过，并且当场指认了嫌疑犯，警察抓住了嫌疑犯，事情一下就传开了，媒体铺天盖地大肆报道，为了躲避媒体，素媛转移了病房，转移的时候，爸爸急忙之下弄翻了素媛的排便袋，素媛觉得很丢脸，不让爸爸帮她清理，但是爸爸又急着把素媛排便弄脏的衣物脱下来，爸爸的行为让素媛又再次回忆了那段噩梦，小小的心灵再次受到重创，大叫大哭后的素媛，放弃了抵抗，此时的爸爸才意识到自己的行为错了。
生命垂危
与玩偶的对话
充满爱心的人们也都来帮助这个破碎的家庭，同学们写了很多小纸条贴在素媛杂货店的门上，鼓励她，给她信心，希望素媛能早日回到学校。 素媛出院之后回到了学校，同学们都对她很友好，素媛的爸爸每天上下学都乔装成玩偶陪着素媛，一天放学回家的路上，素媛对着布偶说：“你是不是爸爸”，爸爸在玩偶里满头大汗，犹豫不知道该怎么回答，素媛牵着布偶的手一起回到杂货店，摘下了布偶的帽子，看到了满头大汗的爸爸，素媛帮爸爸擦汗，爸爸眼睛红了，妈妈也哭了，看到这一幕，眼泪不争气的流了下来。
给爸爸擦汗
正当一切都快回到原来的样子时，法院的传唤书来了，因为当时的素媛受到重创，意识模糊，法院表示对当时素媛的陈述和指认有所怀疑，需要素媛再一次上庭作证，这不是又再一次把孩子往火坑里推吗？
重新回到学校的素媛
素媛的爸爸来到监狱，猥琐大叔以为他是来和解的，还威胁素媛爸爸，素媛的爸爸气到拿起凳子直接砸向玻璃，并告诉猥琐大叔不会就此妥协。为了让坏人受到应有的惩罚，无奈地素媛再次上庭，很淡定的回答了所有的询问，并指认了猥琐大叔，可是猥琐大叔始终不承认，说自己酒精中毒，不记得当时的事了。
出庭指证
最后法官宣判关押12年，并驳回素媛家提出的赔偿申请，听到这个结果，在场所有人都愤怒了，对此次宣判结果非常不满，但是法官还是用很坚硬的语气说：“就是判12年”。素媛的爸爸忍无可忍，决定用自己的方式来解决。素媛的爸爸拿起检察官的牌子，准备砸向猥琐大叔时，素媛冲了上去，大哭抱住爸爸的腿，她不想自己的爸爸杀人犯罪而坐牢，爸爸像失了魂一样说：“咱们回家，咱们回家“。整件事情就这样无奈的结束了。
抱腿大哭拦住冲动的爸爸
最后素媛的弟弟出生了，新的希望，新的生活，新的开始，他们一家又回到了原来的样子。心灵的创伤，是抹不掉的，她只能埋在心底，生活还要继续，希望所有受过创伤的孩子，不要放弃自己，要对生活抱有希望。 希望这个这世界能够对所有的孩子温柔相待，也希望坏人能受到法律的制裁，得到应有的惩罚。
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