故事梗概很简单：公元2015年，14岁少年碇真治应父亲的要求来到第三新东京市，同日，被称为使徒的巨大怪物来袭。因为第一适格者绫波丽重伤未愈，从没受过任何训练的真治被推进了人形机器人EVA初号机的插入栓，并成功殉灭使徒，然后一到新班级就成了英雄。
但可惜的是，这个故事却并不如这种小学生流水账作文般简单。作者大篇幅的意识流描写，对人性的复杂进行反复地刻画解读，使得这部诞生于1995年的26话TV动画成为了时至今日仍被称为神作的作品。
男主真嗣似乎总是和JUMP里面天生热血的男主角大相径庭，甚至他软弱，自闭，明明渴望温暖却又拒绝温暖。
但是啊——
“这男人的温柔，比海还深。”
他把别人的生死看得比自己还重，害怕别人死，害怕他人受伤，即使选择过逃避，却也不是贪生怕死这样懦弱的理由。在他被三号机掐住脖子的时候，驾驶员是那位曾经对他拳脚相向的同学，他却也从未反击。
但是在他想要变强，想要成长，想要保护他人的时候，这个故事的残酷也由此凸显出来：世界并未因为这个少年的试图努力而发生任何美好的改变，即使获得了一再的胜利，也只是意味着更加接近破灭的终局。
作为“三无少女”始祖的绫波丽出场也十分特别，缠着绷带的孱弱形象一下子激起了真嗣的责任感，或许作为拥有真嗣母亲DNA的克隆人在精神上与他重逢后获得了精神上的共鸣，才促使这个软弱到称不上是主角的男孩有了成长的勇气。同样的，绫波丽虽然只是若干个“复制品”之一，但是却慢慢地学会思考，拥有自我意识，甚至会舍命保护真嗣，并且在对他说下自己“不知道该用什么表情来面对”的疑问后，听取对方“微笑就好”的意见。
女神的微笑
刚出场的明日香，嚣张跋扈，当然聪明如她美丽如她在十四岁的年纪也该高傲如她。童年经历带给她的伤痛让她与自己约定不再哭泣，这也导致了压抑了一个处理感情的良好方式，以及故事后期她的脆弱与扭曲。与碇真嗣的相遇，或许是经历以及自我认同都有相同之处，两个人从一开始的相互敌视，争吵到后来的相互陪伴与遇到危机时的相互支持，两个不同的自我，最后得以相互补全。
无论是TV版中在湖边夕阳下吟唱《欢乐颂》，还是漫画中在一片废墟中弹奏贝多芬，只拥有559秒镜头的渚薰无疑是动漫界的一个奇迹。浅灰色的头发，红色瞳孔，纤长的手和瘦弱又高挑的身躯让人印象深刻。除此之外的便是，身为第五适格者真实身份却是第十七使徒的反转。他与真嗣的情感却又是另外一个让人捉摸不透的点，短暂的559秒，两人经历了相遇相识相知以及最后渚薰袒露自己的身份死于真嗣操纵的初号机手里。剧场版Q中的他可以说是唯一爱着那个被所有人抛弃了的真嗣，他不再像TV里面那样处理感情游刃有余，知晓剧本走向却又没有考虑自己的命运，在他的考虑之中全然是怎样让真嗣获得幸福，甚至最后选择代替真嗣死亡。
“我就是为了和你相遇而出生的”
"少年对成人社会的抗拒"是个动画中经常出现的主题，EVA里的大人们，任何一个都做不到所谓温柔与宽容的注视，更谈不上成为能让心里带伤的孩子们痊愈并且成长的"环境"，因为他们实在没那个空闲——顶多提供一些礼貌性的安慰，或者心有余力不足的关注。三个孩子诚然性格迥异，甚至是南辕北辙，但骨子里的不安和脆弱却又使他们殊途同归。
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