凱撒大帝
公元前49年，愷撒只率領一個軍團渡過盧比孔河。龐培認為，愷撒必然會等待主力集結後，才會發動進攻，因此，他們毫無防備，愷撒只用了幾天時間就殺到羅馬城下。來不及調軍入城的龐培和元老院棄城南逃，愷撒沒有進入羅馬，而是一路追擊到意大利南部。3月4日，龐培剛剛抵達意大利南部海港布林迪西，愷撒就趕到城外並建立包圍圈。但是由於缺乏海軍力量，愷撒沒能阻止龐培勢力渡海前往希臘。
龐培
龐培抵達希臘，意味著愷撒想將內戰限制在意大利半島的計劃失敗了。龐培計劃利用自己在東地中海的影響力和西班牙總督的身份組織力量對抗愷撒，同時，北非總督還是龐培的部屬，所以，實際上整個地中海的東、西、南部都是龐培的勢力範圍。
4月初，愷撒讓副將安東尼、雷必達留守羅馬，自己率軍遠征西班牙，同時派古里奧進攻北非。6月，愷撒率軍抵達西班牙萊利達城。萊利達城下有龐培軍8萬人，而愷撒軍不足3萬。愷撒充分利用地形，挖開河道，用河水圍困龐培軍，使他們無法得到補給。隨後，愷撒為自己在內戰中的合法性做出辯解，並不斷展開心理戰，以動搖敵軍士氣。很快，西班牙軍的中下級軍官和士兵都不願再戰，愷撒表示將保證投降敵軍的生命和財產安全，並且他們都可以退役回家。愷撒順利的平定了西班牙。
羅馬內戰
但是，愷撒軍在北非和亞得里亞海的戰鬥都失敗了。龐培軍有可能從東地中海或北非進攻意大利，戰局對愷撒非常不利。要想挽回頹勢，只能登陸希臘，直接擊敗龐培。公元前48年1月，愷撒出其不意的在惡浪滔天的冬季率1.5萬人成功渡海，但是後續部隊被龐培艦隊封鎖在亞得里亞的海港內。龐培本人則率領5.5萬大軍從希臘殺向杜拉斯城。杜拉斯是希臘西海岸的重要補給基地，囤積有大量武器、糧食，追隨龐培外逃的大量元老院權貴也在城中，雙方在杜拉斯城下紮營對壘。到3月，愷撒的後續部隊安東尼軍與愷撒會和，愷撒開始修建包圍工事。龐培則打算依靠補給優勢一面拖住愷撒，一面等待自己岳父梅特盧斯的軍隊。
到6月，愷撒完成了長達25公里的包圍工事，可是能用於防守的兵力卻只有2萬人。龐培依靠優勢兵力同時對多處堡壘發起進攻，愷撒軍拼死抵抗，使龐培軍沒有取得進展。後來，愷撒軍中兩名軍官因剋扣軍餉被告發而叛逃，他們將愷撒軍的兵力部署告訴了龐培，龐培隨即發起進攻，愷撒軍大敗。
愷撒本就兵力不佔優勢、補給也不足，這次大敗使愷撒軍士氣低沉，愷撒決定孤注一擲。他率軍向內陸撤退，做出攻擊梅特盧斯軍團的姿態，目的是引出龐培軍決戰。龐培雖然看出愷撒的意圖，但他也認為是時候徹底擊敗愷撒了，於是，龐培率軍尾隨追擊愷撒。
法薩羅之戰
公元前48年8月，愷撒與會和後的龐培、梅特盧斯會戰於法薩羅平原。愷撒有2萬步兵、1000騎兵，龐培軍由5萬步兵、7000騎兵。龐培計劃用優勢騎兵先擊潰愷撒側翼，再完成對愷撒主力的包圍。但是，愷撒察覺他的意圖後，派出精銳的長槍兵抵擋龐培騎兵，並由騎兵和輕步兵配合將龐培騎兵擊潰。失去騎兵的龐培在愷撒騎兵和重裝步兵的衝擊下，很快就全線崩潰了。據愷撒手記，這一戰愷撒軍陣亡200餘人，俘虜龐培軍2.4萬人。
愷撒率軍繼續追擊龐培，所過之處，曾經效忠龐培的勢力紛紛向愷撒臣服。龐培最後來到埃及，希望埃及當權者念及龐培擁立的舊情而給予支持。但是，埃及人視龐培為麻煩，在亞歷山大港殺死了龐培。愷撒在埃及稍作休整後，領軍前往小亞細亞擊敗本都國王法爾納凱斯，他寫給羅馬的戰報中只有那句著名的“我來，我見，我征服。”
龐培的餘黨大多逃到北非繼續頑抗，他們在隨後的塔普蘇斯會戰中被愷撒擊敗。愷撒基本掃除了境內的反叛勢力，將重點轉移到政治改革上。
羅馬疆域
這時的羅馬已經是一個幅員遼闊的超級大國，以數百人的元老院為統治核心的共和制度，行政效率低下。為了提高行政效率，愷撒決定將羅馬改造成集權的獨裁製度。
愷撒首先推行儒略曆，將一年分成12個月，大小月交替，四年一閏。儒略曆是現行公曆的前身。接著愷撒成立國家鑄幣機構，逐步推行統一的貨幣。公元前44年，愷撒就任終身獨裁官，羅馬進入實際上的帝制時代。
接著，愷撒推行一系列提高集權的改革。首先，愷撒進行官僚機構改革，將整個羅馬劃分為18個行省，行省由行省總督、行省議會實施管理。總督由獨裁官任命。其次，愷撒擴大羅馬公民權的授予範圍，使意大利半島之外的各行省逐步羅馬化。他還鼓勵退伍軍人和無業平民赴各行省拓荒，並授予他們相應的土地，使他們成為自己的重要支持力量。愷撒還設立國家級的稅收機構，統一收繳各行省稅收；設立治安機構，維護城市秩序；設立環衛機構，保持城市容貌；同時，他還大力建設基礎設施，興建廣場、劇院、神廟等，以壯觀羅馬的城市形象。愷撒還出臺措施以吸引各行業有名望的人到羅馬生活，使羅馬的醫療、教育、文化進入空前繁榮。愷撒的聲望因為這些改革措施而不斷高漲，被羅馬公民尊為國父，他的權力已經和普通帝王相差無幾。
反對愷撒的人擔心，他即將稱帝而廢棄延續500年的羅馬共和制度，他們決定刺殺凱撒。其中的領頭者是布魯圖和卡西烏斯，他們都是曾經追隨龐培的元老派成員，在凱撒擊敗龐培後，他們向凱撒投降以得到寬恕，並在凱撒治下繼續享受高官厚祿。
凱撒遇刺
公元前44年3月15日，凱撒前往元老院召開會議，由於時間尚早，會場只有預謀刺殺凱撒的人。他們將凱撒圍住後，便舉起短劍刺向凱撒。3月18日，羅馬市民為凱撒舉行了國葬，並按照法令將凱撒列入羅馬眾神行列。
