2019年12月底，sars-cov-2已在法国蔓延。
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https://doi.org/10.1016/j.ijantimicag.2020.106006
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高光
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2019年12月底，冠状病毒已经在法国蔓延，一个月前（2019年11月），法国正式出现了第一批病例。
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早期社区传播改变了我们对冠状病毒流行的认识。
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这一新病例改变了我们对疫情的理解，模型研究应适应这一新数据。
摘要
据信，法国的冠状病毒流行始于2020年1月底。我们在此报告一例病例，一名病人于2019年12月在我们的重症监护病房住院，我们的医院位于巴黎北部，因咯血而没有病因诊断，并对已储存的呼吸道样本进行了回顾性RT-PCR检查，证实了对冠状病毒感染的诊断。根据这一结果，看来冠状病毒流行开始得早得多。
关键词
COVID-19重症监护病房
导言
新冠状病毒(SARS-COV-2)在中国于2019年12月发病后，在多个国家广泛传播，引起冠状病毒病。1世界卫生组织(WHO)于2020年3月11日宣布冠状病毒大流行。3法国于2020年1月24日报告了首例与SARS-COV-2相关的感染病例.5这两起案件都有去武汉旅行的历史。6据我们所知，这2例病例被认为是法国第一例确诊病例。冠状病毒最常见的流感样疾病(ILI)。7当中国面临冠状病毒爆发时，欧洲国家正与季节性流感作斗争。8临床症状的冠状病毒与ILI相似，因此我们决定回顾性地在巴黎附近的重症监护病房(ICUS)收集的呼吸样本中寻找SARS-COV 2。
方法-回顾性分析
选定记录
我们回顾了在2019年12月2日至2020年1月16日期间因ILI而入院的ICUS患者的医疗记录，并在入院时进行了阴性的RT-PCR检测。我们在医院采集的每一个呼吸样本都被冷冻在-80°C的温科-86°C冰箱中，并储存了四年，以备进一步分析之用。根据病史，对有ILI症状(发热>38.5°C、咳嗽、鼻炎、咽喉痛或肌痛)和磨玻璃混浊的患者进行SARS-COV-2RT-PCR。示例选择的说明可在图1.
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图1. 测试的选择过程。
严重急性呼吸系统综合症冠状病毒-2
COVID-19的测试
于2020年4月6日至9日对14个选定的生物群落进行了SARS-COV-2RT-PCR检测.RT-PCR严格按照Charité协议进行。11针对E基因，编码SARS-COV-1和SARS-COV--2包膜蛋白，在QuantStudio7(热裂变器)装置上进行编码。积极结果(图2)根据制造商的命令使用基因查找器COVID 19 Plus RealAmp工具包(IFMR-45)确认。本试验针对3个病毒基因(RdRp、E和N分别编码病毒RNA依赖的RNA聚合酶、包膜和核衣壳蛋白)和细胞RNase P基因，以确定呼吸道标本的质量。
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图2. Charite协议RT-PCR检测结果。
病人的边缘黄色，阳性和阴性的测试样本，紫色)
结果：
在研究期间，58名因ILI入院的病人中有14名(24%)被纳入我们的分析(表1)，其中一份样本来自阿尔及利亚一名42岁的男子，他在法国居住多年，从事养鱼业。他最后一次访问阿尔及利亚是在2019年8月。他的一个孩子在症状出现之前就出现了ILI。他的病史包括哮喘，II型糖尿病。他于2019年12月27日来到急诊室，表现为咯血、咳嗽、头痛和发烧，病情持续4天。初步检查不明显，CT扫描显示下叶有双侧磨玻璃混浊(图3)。入院时，他淋巴细胞减少，C反应蛋白和纤维蛋白原升高，而降钙素Pro在正常范围内。在急诊室采集的痰标本中未检出病原菌。该病人接受抗生素治疗后进入ICU，直到2019年12月29日出院。
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图3. 胸部计算机断层扫描在基线处进行。
下叶出现双侧磨玻璃混浊
讨论
我们报告在我国第一例报告病例前一个月观察到一名感染冠状病毒的病人。入院时，病人出现了临床症状和放射学模式，这是中国人以前经常看到的。12和意大利语13队列。鉴定第一位受感染的病人具有很大的流行病学意义，因为它极大地改变了我们对SARS-COV-2及其在全国的传播的认识。此外，由于缺乏与中国的联系，以及最近没有旅行，这表明到2019年12月底，这种疾病已经在法国人口中传播。
需要进行进一步的研究，以评估SARS-COV-2在法国领土上的实际发病情况，2019年末和2020年1月人口中SARS-COV-2污染的实际程度，并探讨当时可能发生的未被注意到的潜在死亡情况。据认为，截至2020年4月10日，冠状病毒导致了86334例和12210例死亡。4在法国，但我们的发现表明，这些数字可能低估了冠状病毒的实际负担。最近的两项研究表明，感染sars-cov-2的人中有18%至23%是无症状的。16约55%的感染者是由不明原因的感染者引起的。17我们的结果有力地支持了这两个假设，表明许多无症状的患者在2020年1月期间没有被诊断，并导致了这一流行病的蔓延。
此外，由于这些结果改变了我们对疫情动态的理解，这也意味着用于预测SARS-COV-2传播的演变和结果的几个模型可能基于有偏见的数据，需要根据疫情的实际情况进行调整。18
我们的研究有几个局限性。首先，由于所进行的分析具有追溯性，医疗记录并非详尽无遗，可能缺少一些相关资料。其次，由于rt-pcr的敏感性，我们不能排除假阴性结果。19以及一种可能破坏样品质量的存储技术。20为了避免任何假阳性结果，我们已经采取了所有通常的预防措施，我们还通过两种不同的技术和工作人员证实了这一点。第三，我们只对少数样本进行分析，我们选择将选择的记录局限于符合症状和CT的ICU患者，尽管大多数患者实际上有轻微的症状。第四，尽管文献中描述了交叉污染，但我们的分析局限于当时多重PCR阴性的患者。9最后，我们在巴黎北部地区进行了一项单中心研究，该地区在这一流行病中面临着特别沉重的负担。21这些限制可以解释为什么我们只能在我们的人群中识别出一个感染了SARS-COV-2的人。
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