花魁小紫
很高兴回答您的问题，众所周知大侦探工藤新一是在解决云霄飞车杀人事件后追踪神秘组织被灌下毒药致使身体变小，至于为什么要寄居在毛利小五郎家而不是阿笠博士家，笔者认为有三方面的考量：
第一：“单身汉”阿笠博士忙于科研工作无暇照顾柯南
阿笠博士是未婚单身汉，自己的大部分时间都用在了发明上，虽然被新一说研究出来的东西都是一堆破铜烂铁但是兴趣使然他愿意花时间投入研究，所以连自己的生活都是马马虎虎，更别说再来个小孩子了。
第二：毛利侦探事务所是柯南秘密调查神秘组织的根据地
毛利小五郎以前是一名优秀的刑警，后来因为一起事件而辞职，成为一名私家侦探，开办了毛利侦探事务所。柯南寄居在毛利家无形中接触了很多案件，通过自己的缜密推理把糊涂侦探的毛利变成了以睡姿推理案情，屡破奇案的"沉睡的小五郎"，因此经常被邀请参加各种活动和各大重案要案，这就为柯南收集神秘组织情报埋下了伏笔。
第三：动漫情节和吃瓜群众的需要
众所周知动漫中工藤新一和毛利兰是情侣关系，变小的新一也就是柯南寄居在毛利家，一方面两位主人公可以“朝夕相伴”小兰情绪的变化会被柯南察觉并能及时的化解，另外一方面小兰作为毛利侦探事务所的女主人善良可爱厨艺高超，能很好的在生活上把大家照顾好。
综上所述，柯南寄居在毛利家是最好的选择，不光是剧情的需要，也是满足广大动漫迷“有情人终成眷属”的情愫，尽管新一身体变小，但是他跟小兰走在一起总有一种初恋般的和谐和美好。
千语讲动漫
在名侦探柯南这部作品中，知道柯南真实身份的角色并不少，其中关系最近的角色，应该还是阿笠博士。
在作品中，柯南变小的第一时间，便是去找阿笠博士。并且阿笠博士也给了柯南很多方便，比如说老是折磨毛利小五郎的催眠针就是阿笠博士的杰作。
但有意思的是，以隐蔽的身份与生活的便捷度来考虑，借住阿笠博士家似乎更为合适，那柯南为何执着于小五郎家呢？
首先我们要确认一点，那就是阿笠博士家其实可以住。
最好的例子就是灰原哀，和柯南立场相近的灰原哀都能住在阿笠博士家中，柯南自然也可以住在里面。
而且从生活成本来看，怎么想柯南和阿笠博士都不缺钱，阿笠博士的房子也够他们生活。
那么柯南为何执意要生活在小五郎的家里呢？
首先第一点，也就是最重要的一点，柯南需要确保毛利兰的安全。
原本柯南就喜欢毛利兰，两人算是两情相悦。若是没有黑衣组织这个意外，他们的人生几乎是非常平坦的。
但如今柯南身不由己，被迫加入到了巨大的组织中与他们周旋，甚至牵扯到国家层面的斗争，那么自己身边人的安慰自然是他最关心的。
为了保证毛利兰的安全，柯南必须要住在小五郎家。
第二点，在作品的前期也说过
柯南是为了将毛利小五郎这个庸才变成传说级侦探，只要小五郎够出名，他就有机会接触到黑衣组织。
从结果来说，也确实如柯南所设想的。在其帮助小五郎一次次侦破案件，成为了“沉睡的小五郎”这个大侦探后，各个组织都找上了他，而他与黑衣组织的距离也确实越来越近了。
最后也是为了规避风险
住在自己家就不用说了，有被监控的危险。（事实上黑衣组织确实派人潜入到工藤家中）
阿笠博士与工藤家关系太近，为了防止暴露同样为了防止阿笠博士出现没必要的风险，远离阿笠博士居住是个很好地选择。
总的来说，离开阿笠博士选择小五郎家，是一个深思熟虑考虑的结果。不可否认有私情的因素，但从结果而言因为柯南对小五郎的帮助，让小五郎人脉越来越宽广、名声也是越来越响亮。
正因为如此，柯南才能一步步走进黑衣组织的视野之中。
黑鼠鼠
我想有三种可能性吧
- 一 更方便调查黑衣组织
在柯南一开始的时候，就有着剧情上的介绍，说是在作为侦探的毛里小五郎家里，可以更方便的调查黑衣组织的信息，毛利小五郎之前也做过警探，虽然现在作为侦探不怎么出名，但是有更多接触案件的机会，所以更有机会接触黑衣组织进而进行调查。
- 二 更好的保护毛利兰
虽然小兰有着很强的空手道技巧，一般的罪犯无法对其造成什么危险，但是作为男孩子，更愿意留在自己心爱的人身边保护她，而且作为侦探的毛利小五郎难免会被一些穷凶极恶的罪犯盯上，跟别说一些报复小五郎和随时都会盯上的黑衣组织了，所以为了确保小兰的人身安全，还是呆在她的身边，做一个小小的守护天使最好不过了。
- 三 更好的隐藏自己的行踪
虽然柯南变小了，但仍然要调查黑衣人的行踪，更是对发生的刑事案件无法置之不理，但是如果直接接触案件的话，很容易暴漏身份，而且一个小学生接触侦破刑事案件的话，更容易引起人们注意，所以要找一个“保护伞”来隐藏自己，毛利小五郎正好充当这个角色，一根麻痹针，一个变声器，利用“沉睡的毛利小五郎”侦破案件，进行调查，是自己不会暴漏在大众之下，更好的隐藏自己的身份，不被黑衣组织发现
