金代登州栖霞（山东）人，字通密，登州栖霞人，号长春子，后赠号长春真人。年十九出家寧海崑崙山（今牟平东面）。师王重阳，和其他师兄弟合称「全真七子」他们是：丹阳子马鈺、长真子谭处瑞、长生子刘处玄、长春子丘处机、玉阳子王处一、广寧子郝大通、清静散人孙不二（马鈺之妻）。全真七子随王重阳一起创立道教全真派，丘处机在王重阳去世后入磻溪穴居，历时六年，行携簑笠，人称「簑笠先生」。后又赴饶州龙门山（今宝鸡市）隐居潜修七年，成為全真龙门派创始人。
金大定二十八年（1188）金世宗召丘处机至燕京（今北京），问以至道，并主持万春节醮事，明昌元年（1190）金章宗以「惑眾乱民」為由，下詔禁罢全真等教，丘处机即归山东栖霞。泰和七年（1207），章宗元妃赠给《大金玄都宝藏》一部。八年（1208）章宗赐所居观额曰「太虚」、「泰和」。贞佑二年（1214）请命招安山东义军杨安儿，深受朝廷器重。兴定三年（1219）居莱州（今山东掖县）昊天观南宋及金朝先后遣使刘仲录往迎。
丘处机於元兴定四年（1220）偕弟子十八人从莱州出发，行程万里，歷时二年，到达西域大雪山（今阿富汗境内）见成吉思汗（元太祖），并劝元太祖戒杀。太祖赐号「神仙」、「太宗师」，弟子李志常作《长春真人西游记》记述经歷颇长。
丘处机秉承全真遗教，主张三教平等相通互融，主张修道教应出家，断绝一切尘缘。主张清心寡欲即為成仙之本根。著述有《大丹直指》书中述九种炼丹方法，主张人体中先后天气可以相交作用结成大丹的原理，著有《鸣道集》、《摄生消息论》、《磻溪集》等书。
元太祖十九年（1224）返归燕京，元太祖赐以虎符，璽书，命其掌管天下道教，詔免道院及道眾一切赋税差役，於是道侣云集。玄教日兴，遂在南京设立八教会并宫观设坛作醮，从而大昌全真教。元太祖二十二年（1227）赐丘处机金虎牌主领道教，七月卒於北京白云观。
