雖然已經對導彈的發射基地進行了毀滅性打擊，但還是不斷的有導彈射向英國，只不過是數量減少了。 在7月初，有少量的導彈攻擊了曼徹斯特(Manchester)和格洛斯特(Gloucester)。盟軍的高層對於這些攻擊來自哪裡感到很困惑。因為盟軍也大致掌握了V-1的射程範圍，而德國人根本就沒有合適的發射地點可以將導彈發射諸如到曼徹斯特(Manchester)和格洛斯特(Gloucester)這么遠的距離。
事實上，德國人正使用一種改進型的德國He-111轟炸機作為發射母機向英國發射導彈。母機一般都是在位於荷蘭的機場裝彈起飛的。這種發射方式在對英國進行大規模導彈進攻以前就開始進行了。這種改進的母機拆除了He-111轟炸機上的炸彈架和與之有關聯的油箱。在轟炸機的左機翼下安裝了一套V-1導彈的發射傳動機構和導彈掛架。更改以後的轟炸機命名型號為He-111H-22。
用轟炸機發射V-1導彈被證明是一件很危險的事情。V-1導彈很重，並且在發射時很容易造成機毀人亡。總共有1，200枚V-1導彈用這種方式發射。同時也造成了77架轟炸機墜毀，其中在一次任務中，僅是有2枚V-1在飛機離開跑道後便提前爆炸就損失了12架轟炸機。
由於此時盟軍在歐洲大陸的迅速挺進，並且轟
炸機損失太大，空中的發射行動在1945年一月中旬取消了。儘管如此，這並不意味著德國人就結束了這個遊戲。德國人已經又發展了一種遠程的V-1改進型號。改進後的導彈減小了彈頭的體積，增加了燃料的攜帶量，射程可以達到400公里(250哩)。德國人在1945年3月由荷蘭境內向英國發射了約275枚遠程V-1導彈。但是英國的防禦體系很輕鬆的就解決了這些最後的喘息式的進攻。最後在1945年3月，帝國終於結束了對英國的V-1導彈打擊。在1944年9月開始的V-2火箭攻擊也同時結束了。
在最後的階段，德國國防軍也向歐洲大陸上的目標發射了約9，000枚V-1導彈，主要的攻擊目標包括比利時的港口城市安特衛普(Antwerp)以及其相鄰的地區，希望能夠中斷盟軍的補給，阻止盟軍前進的步伐。在3月份以後，這些攻擊也結束了。所有的導彈攻擊都發生在從1944年6月13日到1945年3月29日這段時間裡。
德國人也還曾考慮利用德國Ar-234轟炸機來發射V-1導彈。計劃通過臨時安裝在轟炸機背部旋軸上的發射架來進行發射。但是這個計劃僅僅只停留在圖紙階段。
