对于日本这个国家而言，对其国家影响最大的无疑是中国，包括其文字和宗教，这也致使其在后来的侵略战争中自诩为华夏文明正统而自居的原因，而指责我们不正统。不过其实在历史中日本这个国家的文明形态险些遭受大的转向，致使其像二十世纪的韩国那样彻底基督教化。
在我们唐朝初年，李世民即将离世的时候，日本发生了一件对未来影响深远的事，这就是大化改新，日本第36代天皇孝德发动半汉化式的改革，全面学习贞观时期的唐朝制度，同时改国名为“日出之处的国家”，即日本，自此日本不但有了名字，还有了真正意义上的国家文明形态，同时继续隋朝就开始的谴唐使活动，引进中国的宗教文化与制度，从而在不断地接触学习后，大致在中国的中晚唐时期，日本文字形成，同时佛教开始在日本大盛，其中唐朝的鉴真东渡影响巨大，后来南宋时期与日本的宗教往来也是极其密切，致使日本成了汉传佛教的又一个中心，不过当历史走到了一定阶段，就要面临抉择，而日本早在明治维新之前就面临过一个十字路口，即著名的“切支丹时代”。
熟悉明朝时期抗倭援朝历史的人，对入侵朝鲜的先锋主将小西行长可能不会陌生，而其正是被基督教化的一个大名，而这里之所以提到他就在于他正是那个十字路口中没有被选择的一方，最终历史选择了德川家康和锁国政策，而没有选择小西行长和西化。基督教伴随着大航海时代被南欧人带到亚洲，日本成为最早被传教的国家之一，到了日本入侵朝鲜前的织田信长时代，基督教已经发展到了一定规模，甚至与佛教分庭抗礼，然而到了与佛教关系亲密的丰臣秀吉上台后，其开始排斥基督教，最终颁布颁《伴天连追放令》：
一、日本神国也，西国传来之基督邪法，万万不可接受。
二、传教士令诸国郡之民归附，捣毁神社佛阁，实乃前所未闻之事，诸国郡知行，亦得遵天下之法，故需对其严加约束，不可任其妄为。
三、传教士皆以其知识博取信徒，乃至破坏日本之佛法，诚不当矣。故其不可留于日本，当自今日起二十日内归国。
四、黑船之仪，系贸易之事，应予区别，今后亦可进行长期贸易。五、不妨害佛法之商人，纵来于基督之国，亦予准许。
然而实际上这位完成日本统一的政治家的这纸命令最终取得的效果就如同其入侵朝鲜的效果一样，基督教的传播依旧是畅通无阻的，一方面在于当时的日本没有锁国，有西方商业存在就不可能排除基督教的因素，另一方面基督教传播半个世纪之久，底层民众甚至上层的一些大名，如小西行长都已经受洗礼了，这种程度的禁教自然不可能取得成效。或许对基督教颇为反感的丰臣秀吉还想进一步采取行动，但人熬不过天命，其在十六世纪末突然去世，由此在即将踏入十七世纪的日本走入了一个交叉路口，是通过彻底的清洗手段灭绝基督教还是顺其自然被基督教化。1600年，十七世纪的第一年，决定未来日本国运同时也决定着基督教命运的关原之战爆发，最终极度排斥基督教的德川家康阵营获胜，而小西行长的石田三成阵营惨败，两人后被处死，三年后德川家康在今东京建立德川幕府，自此对基督教有炼狱之称的德川幕府时代开始。
从德川家康，到德川秀忠，再到德川家光，这三代人在四十年的时间里对基督教进行了最大程度的迫害，“京都大殉教”、“元和大殉教”“江户大殉教”、“平户大殉教”“东北大殉教”，到1644年，最后一位耶稣会士殉教为止，期间造成的死亡人数已经与后来其发动的南京大屠杀不相上下，只是此时他们的屠刀伸向的是自己的人。或许是日本的幕府吸取了罗马帝国的经验，因此才能想出“云仙地狱”与“踏绘”这种方法，最终也彻底实现了基督教在日本近两个多世纪的绝迹，日本的切支丹时代彻底结束。
