今天是生信星球陪你的第487天
大神一句話,菜鳥跑半年。我不是大神,但我可以縮短你走彎路的半年~
就像歌兒唱的那樣,如果你不知道該往哪兒走,就留在這學點生信好不好~
這裡有豆豆和花花的學習歷程,從新手到進階,生信路上有你有我!
花花寫於2019-11-18
抱歉前兩天的關鍵詞”富集輸入“,由於我晚上臨時出去,所以上傳晚了,我補上了哈,這一篇:
對不起,過紀念日去了,沒學習,來點富集分析給大家補營養
今天的內容是,話說有個大佬,他開發了一個牛批的新包。
為啥子開發新包
這要從兩個牛批的老包說起。
dplyr
先科普一下dplyr,是Rstudio首席科學家hadly大佬的包包套裝tidyverse裡最能打的一個包,將基礎包$,[ ]這類亂碼式的語法變得可讀性更好,複雜的功能簡單化,大大減少初學者的學習成本,是我的真愛
氮素,被吐槽的比較厲害的是處理大數據的速度(小的數據就憋說了,速度不重要)。
data.table
其實data.table裡面我只用過fread這個函數讀取數據,非常能打,又快又智能,也是我的真愛。但他的語法就不如dplyr優秀了,大佬專用系列~
有人整理了data.table和dplyr包的對比:
還有兩張截圖就不放了。
對於這兩個包的優秀程度,從我以前寫的這兩篇筆記可見一斑:
寫給零基礎同學的R語言第四篇教程-神奇R包dplyr
超有誠意的R語言數據讀取指南(長文慎入)
pia的一下雙劍合璧了
大佬衝冠一怒寫了個新包出來,把他倆雙劍合璧了!登上CRAN的時間市11月12號,下圖市他的介紹現場。
他明明是個實力派,但是顏值跟PPT都不允許啊。
放張大圖,如果看到這裡你已經看不懂了,就去文末看圖舔屏吧。
dtplyr腫麼用?????
吹爆,首發介紹的博客地址是https://www.tidyverse.org/blog/2019/11/dtplyr-1-0-0/
最基礎的用法灰常簡單:
加載
library(data.table)
library(dtplyr)
library(dplyr, warn.conflicts = FALSE)
懶蛋表格?
✨重點是將你的tibble數據結構改一下:
mtcars2 class(mtcars2)
## [1] "dtplyr_step_first" "dtplyr_step"
具體改成了啥類型不打緊,重要的是改這麼一錘子,就能提速了!
假裝還在用dplyr:
下面的語法還是dplyr的語法,但其實已經被翻譯走啦,速度槓槓的:
mtcars2 %>%
filter(wt < 5) %>%
mutate(l100k = 235.21 / mpg) %>% # liters / 100 km
group_by(cyl) %>%
summarise(l100k = mean(l100k))
博客裡面,後面的代碼是大佬為了表示提速了他很膨脹,就不用演示了,直接上結果:
差別不在一個數量級啊!!!!
是他,是他,就是他!我的偶像,大佬哈。長得這麼好看,又優秀又努力,還能不能給別人留點活路了~
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