豬棚空舍時的消毒程序，是豬場日常消毒工作的核心，概括為八步消毒法，即“一清二洗三泡四除殘，五霧六白七燻八空欄”。
一清：指徹底清掃各種有機汙染物，特別是一些衛生死角，甚至需要拆卸設備、搬動漏糞板，還包括屋頂、窗子上的蜘蛛網、灰塵等。
二洗：對棚舍地面、牆壁及不可拆卸設備進行沖洗和刷洗。
三泡：對一些地面進行淺水消毒液浸泡，至少保持24小時，這與豬棚建築設計時有沒有考慮地面浸泡消毒措施有關。
很多養豬場這個程序沒有辦法做，如地面坡度過大、無法蓄水等。還有就是一些可拆卸的設備如產床扣板、保育床扣板、教料槽、仔豬保溫間墊板、麻袋片等，也必須消毒液浸泡24小時以上。
四除殘：對上述三步消毒措施後殘留的消毒劑用大量清水進行沖洗。
五霧：在前四項措施的基礎上做全面的霧化消毒，特別是屋頂和空氣消毒，要求霧化效果好，這樣消毒劑在空氣中的停留時間會盡可能長。
六白：用石灰乳對豬接觸到的牆壁、地面、料槽等進行刷白，就是把可能殘留的有害病菌病毒或寄生蟲殺掉。
七燻：關好門窗用福爾馬林或其它高效消毒劑燻蒸消毒。
八空欄（棚）：至少空棚1周以上。空欄的意義巨大，但是現在很少有養豬企業能夠做到，主要是投資成本問題。
消毒是有毒副作用的，不要盲目消毒，更不要過度消毒。完全消滅病原微生物是不可能的，也是不現實的，更是沒有必要的，如何在你的豬場建立一個健康的微生態平衡系統才是重要的。
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