這部新的《黑鳳凰》電影借鑑了原版漫畫《黑鳳凰傳奇》的故事情節，故事情節在1976年至1980年神秘的《x戰警》系列中慢慢展開。儘管這部電影給出了一個恰當的結局，但在漫畫版的故事中，事情並沒有那麼簡單。
《黑鳳凰傳奇》(Dark Phoenix Saga)是漫威漫畫《x戰警》(X-Men)系列故事中最具標誌性、最受歡迎的一部，原因在於，它將漫威漫畫團隊的一名原成員設定為一個非常簡單、非常史詩般的成長弧線:琴·格雷(Jean Grey)獲得了近乎神一般的力量，最終卻被它所毀滅，以至於她不僅背叛了自己的親人，還犯下了種族滅絕的罪行，在導致一顆太陽變成超新星時，她殺死了一顆外星星球上的所有居民。最終，只有琴與生俱來的人性拯救了這一切，如果她不選擇自殺重生，那她將有可能毀滅整個宇宙。
這個故事為粉絲們提供了一個機會，讓他們可以在漫威或DC漫畫中看到一個最受歡迎的角色展現了“絕對的權力會讓人徹底墮落”的格言。誰能抗拒呢?
然而，這並不是最初的計劃;作家克里斯·克萊蒙特(Chris Claremont)和藝術家約翰·伯恩(John Byrne)在《黑鳳凰傳奇》期間共同策劃了《x戰警》(X-Men)漫畫系列。琴·格雷將會被外星人奪去能量，但仍然活著，他的想法是，這為未來黑鳳凰的再次出現埋了伏筆。當時的漫威漫畫總編吉姆·舒特並不喜歡這個想法，他要求重寫，這就是“琴之死”作為最終結局的來源。
這是一個有意留下的結局，儘管克萊蒙特——他在《x戰警》編劇的位置上又待了十年，在伯恩離開《黑鳳凰》幾個月後，他與許多藝術家合作——他在幾個場合開心地調侃《黑鳳凰》的迴歸，只是為了讓粉絲血壓升高。
1985年，《x戰警》對漫威公司來說是如此的成功，以至於漫威為此增加了一個衍生遊戲。原漫畫團隊計劃推出一部名為《x因素》(X-Factor)的新漫畫，講述原漫畫團隊(野獸、獨眼巨人、冰人、天使)重聚的故事。諷刺的是，在《黑鳳凰傳奇》第一集中引入的另一個變種超級英雄炫目者取代了已故的琴·格雷(Jean Grey)。
然而，約翰·伯恩有一個更好的主意:為什麼不把琴·格雷從死亡中拯救出來，讓原來的團隊重新團結起來呢?嚴格地說，這不是他的主意;把琴帶回來的靈感實際上起源於作家庫爾特·布希克(Kurt Busiek)，當時他還是一名大學生，後來和作家羅傑·斯特恩(Roger Stern)分享了這個靈感，後者和伯恩分享了這個靈感。當時擔任《神奇四俠》編劇兼藝術家的伯恩和《復仇者聯盟》編劇的斯特恩一起向吉姆·舒特(Jim Shooter)提出了這個想法，後者也同意了。《X-Factor》也被列入了計劃，推出了一套雄心勃勃的發行結構，整個三季都有一個故事，來恰當地解釋琴·格雷(Jean Grey)是如何在所有人都看到她去世五年後依然健康地活著的。
在正式出版之前，舒特告訴漫威官方粉絲雜誌《漫威時代》，故事情節“將成為漫威歷史上一個真正的里程碑”。
《神秘x戰警》不是《X-Factor》計劃的一部分，這不是意外；琴·格雷的迴歸不僅破壞了《黑鳳凰傳奇》的高潮，實際上還破壞了《黑鳳凰》最初出版時的整個故事情節。它認為，每個人都讀到過的鳳凰實際上根本就不是琴·格雷，而是鳳凰力量本身創造的琴的克隆體；真正的”琴·格雷一直處於假死狀態，直到她被《復仇者聯盟》和《神奇四俠》發現。所有這一切都是在沒有《神秘的x戰警》編劇克里斯·克萊蒙特的參與下決定的——或者，事實上，是在不知情的情況下決定的。
當克萊蒙特發現後，他的第一個衝動是辭職以示抗議。(後來他聲稱，只因他記不住吉姆·舒特(Jim Shooter)的直撥電話號碼，因此也沒能辭職。)但是，他提出了替代方案但都被拒絕了。
然而，在決定出版《X-Factor》之後，不僅僅是琴·格雷的歷史被改寫了。該系列於1985年10月推出，克萊蒙特曾在《x戰警》(X-Men)的第21期中，用《神秘的x戰警》寫出了斯科特·薩默斯(Scott Summers)，又名獨眼巨人(Cyclops);他和妻子馬德琳·普賴爾(恰好長得很像琴·格雷)以及剛出生的兒子一起離開了團隊，進入了超級英雄的退休生活。在《x因素1》中，當薩默斯發現珍·格雷還活著時，他拋棄了妻子和孩子。
也許漫威沒有人意識到，讀者很難把一個拋棄家庭的男人視為一個特別的英雄人物，尤其是當《x因素》(X-Factor)對讓馬德琳或她的兒子出現在漫畫中沒有表現出什麼興趣時，他們更願意看到斯科特·薩默斯自憐地說，“馬德琳和孩子一直在我的腦海裡，但我的生活被徹底顛覆了。”琴回來了。也許漫威的人在看到粉絲們的反應之前都沒覺得這是個問題。不管怎樣，我們必須做點什麼來拯救斯科特·薩默斯。我們可以說，解決方案出乎意料。
馬德琳最終出現在神秘的《x戰警》中，就像斯科特·薩默斯決定回到他的家庭時，卻發現他們失蹤了。這是一個共同的故事情節的開始，一年多後，薩默斯發現馬德琳·普賴爾實際上是由邪惡人創造的琴·格雷的克隆。更糟的是，她是一個克隆人，為了追求權力曾和一個惡魔做過交易，現在正打算犧牲她的兒子。
這是一個試圖挽救薩默斯聲譽的retcon——解決方案是琴·格雷吸收她的邪惡克隆人和鳳凰城的假琴·格雷的記憶，並啟動一系列事件，最終薩默斯的孩子會被送到遙遠的未來，這樣他就會成為凱布爾，所以我們只能說這個問題還沒有定論。
by Graeme McMillan/小白翻譯
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