新冠病毒潜在靶点全筛选

2020年3月22日,生物学预印本期刊在线发表了一篇通过新冠病毒SARS-CoV-2蛋白与人蛋白相互作用筛选潜在治疗靶点的文章。文章作者来自加州大学旧金山分校(美国新冠病毒研究的重要中心之一)等多个单位,题目为“

A SARS-CoV-2-Human Protein-Protein Interaction Map Reveals Drug Targets and Potential Drug-Repurposing”。

新冠病毒潜在靶点全筛选

文章的思路简单,但工作量极为庞大。研究人员表达了新冠病毒SARS-CoV-2的29个蛋白中的26个,通过亲和层析分别capture与各病毒蛋白相互作用的人蛋白,质谱鉴定(亲和层析纯化-质谱,即AP-MS)。共鉴定出332中高置信度的与病毒蛋白相互作用的人蛋白,其中66个可以作为潜在靶点,已经有上市、临床或临床前阶段的69个候选药物靶向这66个潜在靶点。

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与SARS-CoV-2相互作用的332个human protein如下图所示。

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已有候选药物的靶点与蛋白相互作用的网络图如下所示。

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这篇文章的思路并不复杂,但反映了美国强大的科研组织和动员能力,这些基础研究的线索为后续探索新的治疗药物提供了重要依据。

作者同时也提供了文献等来源的潜在靶点的药物统计情况。根据文献,有15个上市药物、4个临床药物、18个临床前药物(下表1a)。根据专业知识,有12个上市药物、10个临床药物、10个临床前药物(下表1b)。

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