與施用氮、磷、鉀大量營養元素肥料一樣，作物施用微量營養元素肥料一般也有兩種方式：即土壤施用固體微肥和葉面噴施液體微肥。
但不同的是，由於作物對大量營養元素的需要量大，所以應以土壤施肥為主，通過龐大的根系來吸收；而作物對微量營養元素的需要量少，葉面噴施的效果要比土壤施肥的效果好。據資料，畝產66.7千克皮棉及其莖葉全部營養元素的吸收總量為10.5千克，其中帶走的微量元素僅為54.4克，其中：鐵28.3克，錳4.9克，鋅14.2克，銅2.7克，硼3.9克，鉬0．4克。畝產3 333千克的番茄及其莖葉全部營養元素的吸收總量為35千克，其中帶走的微量元素僅為91.9克，其中：鐵50克，錳9.3克，鋅18.5克，銅5.1克，硼8.9克，鉬0.1克。對如此很少量的養分，只有採用葉面噴施才是最佳的選擇。其理由如下：
(1)用量少，比較經濟。土壤施用微量元素肥料，一般是作基肥施用，所以用量大，一般畝施0. 5-2．O千克不等，而葉面噴施微肥，一般濃度很稀，所用肥料則很少，因而葉面噴施微肥比較經濟。
微量元素含量低
(2)避免固定。向土壤施用微肥，由於受土壤條件的影響，會使其有效性降低。例如，在石灰性土壤中，硼能以陰離子的形式被土壤膠體吸附，而降低其有效性；又如，在酸性土壤中，鉬也能以離子的形式存在，並被土壤膠體吸附固定，使作物難以吸收利用。而葉面噴施微肥，養分就可以從葉片角質層和氣孔進入，不和土壤直接接觸，從而避免土壤固定。
酸鹼度過大都影響微量元素的有效性
(3)養分吸收快、效率高。施人土壤的養分，要通過根系吸收才能進入植物體；而葉面噴施的微肥，能直接與植物莖葉接觸，因而吸收和運轉都比根部快，利用率也高。
(4)易於控制濃度。由於作物缺乏微量營養元素的濃度與中毒濃度之間的差距很窄，土壤施用微肥用量較大，不易施勻，極易發生局部中毒現象；而葉面噴施微肥，濃度容易控制，比較安全。
臨界值低易於控制濃度
(5)減少汙染。向土壤施用的微肥，通常用量較大，往往除了一部分被作物吸收外，其餘的微肥均殘留在土壤中。由於它們多數是重金屬元素，如鋅、錳、銅等，一旦過量殘留於土壤中，就有可能造成汙染；而葉面噴施微肥，濃度低，數量少，不會造成土壤汙染。
通過以上比較，可以說明葉面噴施微肥具有經濟、高教、安全和無汙染的特點，它比土壤施用微肥的效果要好得多，成本也低，值得提倡。
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