南北塞浦路斯之間複雜的政治與民族關係起源於非常久遠的時代。 歷史上可以找到、關於此島最早的歷史記載是塞浦路斯是屬於亞述帝國的版圖之一，島上的民族屬於古代腓尼基人與希臘族後裔，並且在公元前58年時，成為羅馬帝國的一個行省。在塞浦路斯屬於羅馬帝國統治的時代，包括保羅、巴拿巴與馬可在內的幾位耶穌門徒都曾造訪過塞浦路斯島的居比路，保羅將基督教帶到該島上，而巴拿巴則建立了第一座塞浦路斯教會。因此，塞浦路斯成為地中海地區最早開始信奉基督教的地區，而今日島上的希臘裔居民也都是信奉希臘正教，屬於基督教的一支。
伊斯蘭教和土耳其移民進入
而另一方面，信奉伊斯蘭教的土耳其人則得到了公元16世紀以後才來到塞浦路斯島。1571年奧斯曼帝國從當時擁有著塞浦路斯島的威尼斯共和國手中搶下此島的控制權，開始鼓勵土耳其士兵主動攜家帶眷移民到該地，新進入的土裔移民對於島上原本的希臘裔居民來說有很強烈的排擠效應，因而種下數百年後分裂狀況的伏筆。在17世紀奧圖曼帝國最強盛的時代是移民潮的高峰，在這段期間島上的希臘正教教會是希臘族裔唯一的凝聚力量。
英國殖民時代
1878年時，為了防止沙俄勢力的南侵，奧斯曼帝國以塞浦路斯換取英國在俄土戰爭中對該國的支持，正式將該島的行政權轉移給英國，但是保留該島的宗主權。 1925年英國與土耳其簽訂洛桑條約，塞浦路斯正式成為英國殖民地。而在英國統治期間，塞浦路斯島上的希臘居民一直在討論與爭取回歸希臘“祖國”的可能性，甚至組成極端右翼的塞浦路斯鬥士國家組織EOKA。在EOKA組成後的四年間，他們持續地攻擊了許多屬於英國的設施目標，而英國當局也以保護土耳其裔居民的理由武力反擊。
南北隔離
相對於希臘裔居民的激進，島上的土耳其裔居民對於英國人的殖民統治異議較少，傾向支持維持這樣的現狀以求取安全保障。而為了減少治理上的困難，效法之前在英屬印度因宗教而使用的印巴分治措施，英國在塞浦路斯島上導入了“隔離區”的概念，在島中央建立起一條分隔線將希裔與土裔人民隔開。族裔的劃分方式主要是以居民的信仰為主，成為主要是信仰希臘正教的南塞浦路斯，與主要是信仰伊斯蘭教的北塞浦路斯，後世有人評論認為英國這種做法讓他們變成加深塞島上族群歧異、降低國家認同感的始作俑者。
蘇黎世協定與獨立建國
1959年，在塞浦路斯島上的族群衝突升高到一個無法收拾的頂點之後，各方開始在聯合國的斡旋下共商思考解決問題的可能。2月11日，希臘與土耳其先在瑞士蘇黎世簽訂關於解決塞浦路斯問題之原則性協定，而後在2月19日時蘇黎世協定正式簽署，由英國片面決定塞浦路斯憲法的大綱，稍後才獲得希臘與土耳其雙方的認同，由英國擔任仲裁人的角色，希臘與土耳其作為監護人，三方共同監督和監察塞浦路斯。
蘇黎世協定包含下列重點：
在塞浦路斯島上建立一個獨立的主權國家。
禁止迴歸土耳其或者回歸希臘。
希臘與土耳其軍隊可以3比2的比例屯駐於塞島上。
島上的希臘族居民與土耳其族居民分開進行國家元首選舉，希族部分選出的元首擔任塞浦路斯的總統，而土族部分選出的元首則擔任副總統的職務，共同治理國家。
塞浦路斯內閣需以七名由希族總統指派，與三名由土族副總統指派的閣員共同組成。
任何國政上的決議都需獲得內閣絕對多數的意見才能通過，但是總統與副總統兩人都擁有議案的最後否決權。
英國仍然擔任塞浦路斯的擔保人，並且保有島上兩個軍事基地範圍內的領土主權。
在蘇黎世協定的簽署之後，
1960年8月16日塞浦路斯共和國正式建立。希臘正教大主教馬卡里奧斯三世成為塞浦路斯首任總統。塞浦路斯在獨立建國後即於1961年加入聯合國，成為聯合國第99個會員國。南北決裂
然而，蘇黎世協定雖然促成了塞浦路斯的獨立，卻沒有徹底解決紛爭。島上的希族抨擊複雜的憲法機制沒辦法反映希土兩族群在國家統治權上的比重，在當時，土族居民僅佔全國兩成不到的人口，因此希族認為兩成不到的土耳其人卻擁有內閣決議中十席裡的三席代表，是英國人主導的憲法裡偏袒土耳其人的象徵。
於是1963年11月時，馬卡里奧總統進行了一連串憲法修正欲削減一部分土耳其人的政治特權，但卻遭到土族人民的強烈反彈，最後導致內閣裡的土族閣員全部退出。1964年在塞浦路斯政府的求援之下聯合國維和部隊進駐塞浦路斯，同年，土耳其國會通過投票決定對塞浦路斯用兵確保島上土族人民的安全，但卻在聯合國與北約的反對下被阻止（希臘與土耳其皆在1952年時就已加入北約）。而回應這情況，島上的希臘駐軍也全面撤離塞浦路斯，連原本屬於EOKA的地下勢力也一併被要求離開。
北塞浦路斯宣佈獨立
1974年7月，塞浦路斯中央政府發生一場由希臘軍事獨裁者暗中支持的軍事政變，想要利用這方式促成塞浦路斯迴歸希臘。這場政變給了土耳其一個發兵的機會，土國政府以手上握有的擔保條約為由控告希臘方面違反約定，並於7月20日出兵塞浦路斯，在兩波攻勢之下佔領島上38%的領土。在衝突之中有大量原本居住在南賽境內的土耳其人逃往北塞浦路斯，同樣，也有一部分原居住在土耳其控制區域內的希臘人逃往島南，成為某種程度的種族與信仰純化運動，再次加深原本已經非常歧異的意識。
1975年由土耳其控制的北塞浦路斯片面宣佈成立塞浦路斯土族邦，該名稱在1983年11月15日時更改為北塞浦路斯土耳其共和國。北塞浦路斯迄今為止只有土耳其承認，但卻實際上擁有此島北半部的實際統治權，在此狀況下土耳其並不承認塞浦路斯政府對於全島的主權，只稱呼塞浦路斯共和國政府“南塞浦路斯的希臘族政權”。相對之下，島南的塞浦路斯共和國仍然握有包括聯合國會員資格在內的國際認同，但是由於其國會之內缺乏土裔代表的參與，無法滿足當初國家憲法的規範，因此也不能完全代表整個塞浦路斯，塞島一直南北分治到今天。
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