03.05 “五大家族”还是“两个亚型”?新冠病毒基因组研究还在路上


“五大家族”还是“两个亚型”?新冠病毒基因组研究还在路上

对病毒基因组研究和病毒来源的研究,只是为了帮助遏制疫情,而不是为了谴责。

“五大家族”还是“两个亚型”?新冠病毒基因组研究还在路上

而不管最终结果如何,野生动物都不能吃。


“五大家族”还是“两个亚型”?新冠病毒基因组研究还在路上

两个亚型

3月3日,《国家科学评论》发表了一篇题为《关于SARS-CoV-2的起源和持续进化》的研究论文,分析了公共数据库收集的来自2019年12月24日-2020年2月5日的103个新冠病毒基因组数据。北京大学生命科学学院生物信息中心、中国科学院上海巴斯德研究所的研究人员指出:

➤ 新冠病毒于近期产生149个突变点,演化出L(相对年轻,70%)和S(相对古老,30%)两个亚型;

➤ L和S两个亚型的区别在于病毒RNA基因组的第28144位点;

➤ 推测更年轻的L亚型是突变型,毒力更大,传播力更强,更适合人,湖北较多;

➤ S型是野生型,感染能力似乎较弱,但在全球范围的分布更广;

➤ 患者可同时感染L型和S型病毒;

➤ 先前研究中,认为蝙蝠RaTG13和新冠病毒在全基因组核酸序列上4%的区别,遗传距离相当于人类与黑猩猩区别的14倍。


“五大家族”还是“两个亚型”?新冠病毒基因组研究还在路上

五大家族

此前,中国科学院西双版纳热带植物园、华南农业大学和北京脑科学中心科研人员于2月21日发表在ChinaXiv的论文《用全基因组数据解析新型肺炎冠状病毒的演化与传播》中显示:

➤ 在新冠病毒近3万个碱基中,目前只有140个位置发生过变化,其中位于编码区的只有120个;

➤ 收集到93个新型冠状病毒样本的基因组数据,得到58种单倍型,又将其分为ABCDE五组,后被形容为病毒的“五大家族”;

➤ 但其实这些基因最大差别不超过0.4%,并且目前任何两个样本之间的区别都小于0.1%,未知其实际分组意义;

➤ 此文还将武汉病毒研究所在蝙蝠中发现的冠状病毒RaTG13作为源头,并假设存在中间体病毒mv1,以此推断各个样本与mv1的相似度,以确定演化顺序;

➤ 而作为假设源头的RaTG13,与本次新冠病毒基因相似度为96%,其差异十倍于此次得到的样本最大差别(4%与0.4%)。

来源:中国新闻网,环球中文网,科技袁人,科研大匠

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