在1948年之后，由于铁托领导下的南斯拉夫联邦奉行“铁托主义”，拒绝服从由苏联的莫斯科发布的命令，因此苏联和南斯拉夫之间产生重大的分裂。在这种情况下，新生的南斯拉夫人民军（JNA）发现自己无法获得新型的武器装备，无法更新自己老旧的二战装备。1950年，西方国家向南斯拉夫伸出了橄榄枝。1951年南斯拉夫军事代表团访问了美国，达成了一项军事援助协定。根据这份协定，南斯拉夫被纳入了MDAP（国防部援助计划），1951年-1958年，JNA在上世纪50年代得到了多种装甲车辆，其中就包括了M36“杰克逊”坦克歼击车。
南斯拉夫人民军装备的M36坦克歼击车。注意旁边的人民军士兵使用的是缴获的德式装备。
1953年-1957年，JNA共得到了399辆M36坦克歼击车，这些M36替代了此前在JNA中服役的苏联SU76自行火炮，执行反坦克和远程火力支援任务。由于当时南斯拉夫与苏联的关系较为紧张，因此首批装备M36的部队是守卫南斯拉夫东部边界，以防止苏联发动进攻。幸运的是，这种攻击从未发生过。
阅兵式上的南斯拉夫M36坦克歼击车，车身上的标语意为“十一月大选万岁”
南斯拉夫通过对M36的测试发现，M36装备的90mm主炮的火力较为强大，可以有效的对抗T-34/85坦克，但是面对T-54/55这类新一代坦克时，这门主炮的威力就有些不足。到了1957年，南斯拉夫人认为M36的火力已经无法应对当时的新型坦克，因此计划将其用于支援步兵作战。1959年之后，M36从JNA的步兵团中逐步撤装，但是仍然在很多部队中使用。到了60年代后期，M36开始逐步退出一线作战部队，改为执行训练任务。70年代后，部分M36加装了9M14“萨格尔”反坦克导弹，改为反坦克导弹发射车使用。尽管JNA在80年代开启了大规模的军事现代化进程，但是由于先进武器数量不足，M36仍然在使用。
由于M36在JNA中服役的时间很长，因此在服役期间，M36经过多次改装测试。在一部分M36上，JNA测试了红外夜视仪，这一系统直接取自M47“巴顿”坦克，于1962年开始进行测试，1963年正式投产。在70年代，由于M36原装的福特发动机已经严重老化，因此JNA为M36换装了T-55上装备的B-2柴油机。由于苏联柴油机的体积较大，因此M36的发动机舱进行了修改，将排气管移到了车辆的左侧，并换装了一个大尺寸的开门，安装了全新的空气和机油滤清器。
从退役的M36上拆除的B-2柴油机。
尽管M36在90年代初已经完全过时，但是当南斯拉夫内战爆发的时候，由于装甲力量严重不足，几乎所有的现役M36都参加了战斗。由于南斯拉夫的解体，开战之初M36在波斯尼亚、斯洛文尼亚和克罗地亚都有相当数量的存在，分别被多个势力所控制。
南斯拉夫内战期间，几乎所有战车上都涂有标语。这辆M36的炮塔上标记着“愤怒的姨妈（БјеснаСтрина）”，车身后部喷涂着“逃跑，叔叔（Бјежи Ујо）”的标语。“叔叔”是克罗地亚语Ustashe的塞尔维亚讽刺名字。在这辆战车的炮塔右上角，写着“Mица”，这是女性的名字。
在南斯拉夫内战期间，大部分装甲车辆都主要用于为步兵提供火力支援，因此尽管M36已经老旧，但是依然可以发挥作用。在南斯拉夫的山区，M36的灵活性使其得到了步兵们的欢迎。在南斯拉夫内战期间，M36主要以单独形式或者少量车辆编组，来为步兵提供火力支援。
在战争期间，部分M36车上加装了橡胶履带裙板，试图增强其对RPG火箭弹的防护能力。很难说这种改装是否有效，但是这种改装似乎有助于车组成员提高其自信心。今天，在英国的达克福德军事博物馆中，我们可以看到一辆进行过这类改装的车辆。
南斯拉夫内战中带有橡胶裙板的M36。
战争结束后，由于缺少零部件和过于老旧，大部分M36都已经报废。波黑在短时间内使用了M36，但是随后其装备的M36均退出现役报废。只有新成立的南斯拉夫联盟共和国（南联盟）仍然将其列为现役装备。根据1995年底签订的《代顿协定》，前南斯拉夫的成员国必须减少其装甲车辆的数量。根据该规定，南联盟退役了19辆M36。
在1998年的冲突中，一些驻扎在科索沃和梅托西亚的部队装备有M36，这些M36与“科索沃解放军”进行了交火。得益于南联盟高超的伪装技术，这些M36在随后的北约空袭中，损失并不严重。
1999年南联盟从科索沃撤军时，一辆M36的运输车和美军M1A1坦克擦肩而过。
M36的最后一次参战是在2001年，当时驻南斯拉夫南部地区的M36对当地的阿尔巴尼亚分离主义分子进行了打击。2003年，随着南联盟将国名从“南斯拉夫联盟共和国”改为“塞尔维亚和黑山”，这批M36的服役时间正式超过了南斯拉夫作为一个统一国家存在的时间。2004年6月，M36的所有使用和训练都停止，2005年，塞黑军队中的M36全部退役完毕，进行报废处理，结束了其在南斯拉夫近60年的服役经历。
目前，一些M36还在前南斯拉夫地区各个国家的各种军事博物馆和军营中展出，还有一些出售给国外私人收藏家。
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