寧夏醫科大學前身是1958年建立的寧夏醫學院。1962年改稱寧夏大學醫學系。1972年，上海鐵道醫學院搬遷至銀川，與寧夏大學醫學系合併重建寧夏醫學院。2002年，寧夏衛生學校、寧夏護士學校併入寧夏醫學院。2008年8月，學校更名為寧夏醫科大學。2014年，寧夏師範學院醫學院併入寧夏醫科大學，至此，學校成為寧夏唯一的醫學高等教育學府。
學校是國家教育部、衛健委、寧夏回族自治區人民政府共建高校。有教職員工及醫護人員5600餘人（含直屬附屬醫院），其中專任教師905人，副高以上職稱723人。有雙聘院士1人，博士生導師51人，碩士生導師660人。全日制在校生9293人，其中，博士、碩士研究生1985人，留學生323人。有雁湖、雙怡兩個校區，佔地面積共1700畝，設有13個教學機構，13個教輔科研機構，有12所附屬醫院，20所教學醫院，70餘所實習醫院和實踐教學基地。
學校有醫學、理學和管理學3個學科門類，22個本科專業，其中臨床醫學、中醫學、預防醫學、護理學、藥學為國家級特色專業，9個為自治區級特色優勢專業。有2支國家級教學團隊，11支自治區級教學團隊。有2個國家級實驗教學示範中心，9個自治區實驗教學示範中心。
學校有3個一級學科博士學位授予點，1個博士專業學位授予點，9個一級學科碩士學位授予點，6個專業碩士學位授予點。有8個國家中醫藥管理局中醫藥重點學科，5個自治區級重點學科，4個自治區級優勢特色學科。有科技部省部共建國家重點實驗室培育基地1個，教育部重點實驗室2個，自治區級重點實驗室5個，自治區工程技術研究中心2個。
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