二代火影堪称木叶的发明大师，他发明了大量实用忍术，以及大量禁术，为木叶的忍术发展做出了卓越贡献。但实际上，“二代火影是发明大师”这个设定其实是后期加上的，而且稍显不合理，因为二代火影在某些术的研究上跟大蛇丸没有区别，二者的下场却截然不同。
大蛇丸同样是发明大师，他跟二代火影差了两代人，却是唯一一个继承了二代火影发明思想的科学家。只是因为他擅自做人体试验，被三代火影发现后不得不叛逃离开。可是，大蛇丸和二代火影之间又有什么区别呢？
先说人体试验的问题，大蛇丸做人体试验不被木叶所容忍，原因是这种试验有违人道、亵渎死者，可是二代火影开发的秽土转生何尝不是亵渎死者的术？这可不是我说的，而是三代火影目睹了秽土转生之后亲口说的：
可以看出三代火影的态度还是很坚决的，他看到大蛇丸的人体试验，认为这无法容忍，看到秽土转生，同样觉得无法容忍。问题在于，既然这两种亵渎同样都是无法容忍的，为什么二代火影的名声就那么好，大蛇丸就被赶出了村子？
再说大蛇丸其他的那些不被容忍的术，比如双蛇相杀，这一招是大蛇丸所研究的同归于尽之术，用一个人的命换另一个人的命，这种忍术对于一个想要蓬勃发展的忍村来说也是难以容忍的，所以整个木叶只有大蛇丸的徒弟红豆学过这个术：
而二代火影也开发过同归于尽之术，也就是互乘起爆符。这个术开发出来之后直接被列为禁术，因为互乘起爆符会不断通灵出更多的起爆符，威力强大的同时也无法控制爆炸的范围和规模，会把施术者一起卷入爆炸之中。
还有一些常规忍术的改造，比如二代火影改进了分身术，首创了能够参与战斗的分身，也就是现在的影分身术，这个术被大规模推广，整个忍界都把这个术当做基础来教学，即使这个术有着平分查克拉之后会猝死的风险……
大蛇丸同样改造了替身术，发明了大蛇丸流替身术，可以从嘴里吐出另一个自己。这个术的效果改变了替身术的使用习惯，可以承受伤害之后通过蜕皮来逃脱。从佐助和大蛇丸对这个术的使用过程来看，这个术并不会危害他人生命，可是忍界却依然把这个术认为是邪恶的存在。
说到底，其实二代火影和大蛇丸所做的研究并没有本质上的区别，他们都探求了生死界限、开发了新型忍术，所以二代火影功成名就、大蛇丸却身败名裂就显得很不合理，而这种不合理的根源来自于岸本胡乱修改设定的习惯。
从早期三代对秽土转生的评价可以看出，一开始这个术其实应该是由大蛇丸发明的，到了后期忍界大战，岸本为了让剧情能进展下去，才把这个术划归了二代，这才让二代获得了忍术发明家的称号，同时背负了跟大蛇丸同样亵渎死者的设定，进一步导致了二人处境的不合理。
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