当一直过着原始生活的族群的生活被战争打乱，在各方面均处劣势的他们是屈服还是要高喊自由？答案就在影片《赛德克·巴莱》。
影片开始时当年轻的莫那鲁道跃入水中，那水真的好清澈好漂亮，这片山林之美几个镜头就呈现出来。看了之后，也让人不禁让人向往原住民自由自在的山林生活......不过只是想想而已，以自己的体能，若回到过去当原住民，就算没有被山猪顶死，或是自己跌倒摔死，大概也会很快死于恙虫病......
其实，古人对生命的看法和我们是不一样的，不仅原住民，就说战国时代的平原君，曾经有个小妾只因为嘲笑路人，最后就得惨死(不然大家还怪平原君不尊重人)，而西方也有过动不动拔剑决斗的年代，很多人都因决斗而死，后来到了火器时代，拔剑决斗变成了拔枪，于是产生了决斗手枪，而到西部时代，牛仔拔枪决斗也就不足为奇了。
日本也一样，在幕末时期的土佐（就是坂本龙马的故乡）上级武士遇到下级武士，看不顺眼随便就可拔刀砍杀，是导致土佐下级武士起了倒幕之心的原因之一，而政治暗杀先不论，平常武士只因互相看不顺眼，就拔刀决斗的状况也相当常见，经常有人因此被砍死路边，甚至浪人也常没事在路边试刀随便乱砍人，这不过是幕末时代的事而已，这个随时都有人在乱杀人的日本，离满清割让台湾给日本（1896）也不过就是30年左右而已。所以日本当时自认为“文明”了，其实他们从“野蛮”到“文明”，不过是30年的时间。
之所以东西方都有这样一个人随便杀人的年代，其实是因为古代的医学不发达，人的生命很脆弱，就算没被人杀死，也经常因为疾病、意外，各种原因而早逝，所以对生命的看法反而比现代人豁达，或说人命不值钱，我们看待古人的所作所为，若要做道德价值论断，要回到他们的时代去想，不可“以今非古”。然而，正当深山的各部落一如千百年来的生活、交易、敌对，在他们所不知道的地方，外界却已经起了重大的变化，甲午战争中满清海陆战均败，签订马关条约，割让台湾，片中演出了李鸿章之子李经方，在日轮“横滨丸”上交割台湾，从此岛上所有汉人与原住民的命运就被交到了日本手上。
“横滨丸”的交割，看似与全片无关，但我认为这段起了一个画龙点睛的效果，把整部片的历史格局一瞬间就拉出来，也让人猛然警醒台湾终究受到世界局势影响，就连深居于重山之中的原住民，也无法避免被卷入的命运。至此交叉叙述，莫那所属的马赫坡社的生活尚未有任何改变，但平地的汉人已经先受到冲击，在汉人抗日的段落中听到台语，很多观影的朋友忍不住笑了出来，大概是从赛德克的世界突然间跑到平地的落差感吧。
而汉人抗日的失败也在一两个精微之处就把因果叙述了大半，实在不得不佩服导演的巧思，没有战场纪律与秩序的汉人被轻易击溃，死伤惨重，虽然片中只以一两幕带过，但已经说明抗日义军屡屡战败的原因，而汉人的失败也间接影响了原住民的命运，日本统治台湾的前3年，曾因各地反抗军峰起，台北城还被围攻两次，搞得焦头烂额，日本国内质疑占领台湾根本是赔本生意，不如卖给法国算了，可惜汉人抗日实在不够力，最后日本还是没把台湾给卖掉。
直到后藤新平担任民政长官，对台湾人的习性做了深入的“科学调查”以后，针对台湾人的特性改变策略，开始一边整顿腐败的日本官僚，一边改变政策（如建孔庙），一边招降反抗军（但诱降之后又屠杀），一边建立严密的警察政治，终于把反抗给镇压了下来，而日本也可以逐渐腾出手来往深山推进。在片中，汉人反抗战败后，战犯由汉人拉着游街，拉车人还一直用台语说“让一让”，两旁的人乖乖的让开站在两边，日本军官看着一只猪沿着水沟一直走，这猪就好像汉人一样，被困在沟中，只能照着统治者的意思往前走了。
当日本开始深入开发山林，“阿凡达”式的冲突也就此展开，镜头带着我们与赛德克人一同战斗、投降，驰骋在山林间的猎人在“文明”的压迫下成了搬木头的工人，经常被借故苛扣薪资，看过他们先祖战斗的老树被当成值钱的木材砍伐，善于编织的妇女去帮佣被嫌什么都不会，对此，曾经心高气傲的头目只能藉酒浇仇。
莫那鲁道曾在1911年前往日本参观，而他在1920年及1925年有两次计划反抗，但都失败了，被日人列为“不良蕃”，这两次起事片中没有述说，但是他在日本的见闻片中则透过莫那之口转述给观众，于是我们可以体会他的两难，而在起事前，他的幻觉见到父亲，一同唱歌，部落中女人们歌唱“男人为什么要欺负女人”，以及前往山巅，吟唱战歌而舞蹈，这些歌曲带出了凄凉，也让人好像跟着莫那鲁道，一起融入了那要出草前的心境，又好像是回到历史的过去跟在他身后，看着他唱歌，看着他出发，静静的观察着一切却无法做任何改变，这种感觉是很特别的。
魏德圣导演接受小野专访时，就为开头提出的问题给出了最好的答案：“只有用自己的样子去活着，才是一个『真正的人』！譬如说依照着传统的思维去思考，在传统的猎场做该有的行为，那才是一个真正的赛德克人。搬木头、帮日本人盖房子都不是他们的工作，更不是他们原来的样子。我们现在的人也是这样，什么样的我该做什么样的事情？我去做我不该做的事情，我就不是一个『真正的人』。”
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