為保證反滲透系統的安全穩定運行，需要對系統的運行工況進行實時監測、控制與記錄，而運行工程記錄還是系統汙染分析的基礎數據。常用的監測儀表主要包括壓力錶、流量表、電導率表、酸度表、溫度表、氯表、氧化還原電位表等，甚至廣義的包括壓力開關與液位開關等開關量傳感設備。
監測儀表具有機械與電子兩類形式，除了流量表與壓力錶有機械形式之外，所有上述儀表均有電子形式。電子形式儀表由傳感器與變送器兩部分組成，可以實現監測數據的採集、顯示、傳輸與處理。
（1）壓力錶 壓力錶反映單隻儀表系統所在位置的絕對壓力，也反映兩隻或多隻儀表系統所在位置的相對壓差。某位置的絕對壓力是系統的重要運行參數，也是高壓或低壓報警及系統保護的參數依據。兩位置的相對壓差是系統汙染的參數指徵，也是系統清洗效果的重要指標。壓力錶提供的壓力電信號還是系統恆壓控制的基礎信息。
（2）流量表 流量表反映單隻儀表系統所在位置的絕對流量，也反映兩隻或多隻儀表系統所在位置的絕對流量，是預處理工藝與膜系統工藝流量平衡、膜系統前後段通量平衡及膜系統回收率等系統工況計算的依據。流量表提供的流量電信號還是系統恆流控制的基礎信息。
（3）電導率表 產水電導率是反滲透系統設計與運行的質量指標，通過產水電導率可以直接監測系統的產水水質及汙染程度。由於水溫對水體電導率存在一定影響，電導率表一般具有自動溫度補償功能。
（4）酸度表 PH值是系統設計與運行的指標之一，淡水PH值是產水水質的重要指標，濃水PH值也反映濃水區的結垢趨勢。對於一級系統給水加酸或二級系統給水加鹼工藝，系統給水的PH值指標是給水加藥量閉環控制的基本依據。
（5） 溫度表 反滲透系統給水溫度是系統的基本運行工況之一。對於用換熱器進行給水溫度調節的系統，給水溫度是溫度控制的基本依據。需要進行運行參數標準化處理時，給水溫度的監測與記錄必不可少。
（6）氯表與氧化還原電位表 對於具有加氯殺菌及加亞硫酸氫鈉還原的預處理工藝，需要配置氯表或氧化還原電位表，已監測餘氯濃度或還原效果。
（7）壓力開關與液位開關 為防止系統壓力過高，特別是防止泵前壓力過低，常在高壓水泵前後安裝高壓開關與低壓開關，其中泵前的低壓開關主要是避免無水空轉時損壞水泵。為防止水箱水位過高或過低，還常在水箱中安裝高低水位開關。水箱的高位開關動作時停運前位水泵是防止箱水滲出，水箱的低位開關動作時停運後水泵也是防止無水空轉時損壞水泵。
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