故事劇情大概是這樣的。
（1）1999年初，一顆隕石襲擊了地球，隨後開始外星人正式入侵我地球行動，近一個月時間內，位於木衛2，冥王星的兩處空天防禦基地被毀滅。
（2）1999年2月21日，外星人通過遠距離集束式散合炮轟擊地球，恰被月球抵擋大半，這也就是現在月球表面的月球坑形成的原因。
（3）隨後在同年3月30日，敵先遣軍到達地球平流層，開始利用二級奧術聚能軌道裝置對各國家首度進行精確飽和攻擊，我方戰力全滅。
（4）1999年4月1日，我們野外特戰部隊14中隊隊長被國家叫去，回來後告訴我們，基本所有的特種部隊軍官都在現場，聽說集結特種兵這件事不止我們國家4月5日，我們臨時編排的三萬名精英特種兵活下來的只剩下六千人，躲在了地下防空洞，當時地面上應該一片火海吧。緊急時刻我軍開啟了位於山體中的數百枚核彈轟掉了對方的空天戰列艦。
（5）對方撤退後，地球防衛軍乘勝追擊於5月6日在火星軌道內與外星人展開戰鬥，史稱萬艦聯合會戰。
（6）1999年7月，火星人決定幫助地球防衛軍，外星侵略者惱羞成怒將挪威夫斯基粒子聚合彈投擲於火星表面造成全球性的生化災難。接觸到的人都會因為身體代謝被加強導致虛脫死亡，死後屍體形同乾屍。

（7）在1999年冬，自衛反擊戰終於獲勝，地球人並與侵略的外星人以及外來同盟簽訂了《世紀末互不侵略星系同盟協定》，然後戰火紛紛的地球開始了重生!
（8）事後聯合國討論，希望用新研製的藥水抹去所有人關於那次戰爭的痛苦的慘絕人寰的記憶，於是挑選了三名領導和10名化學專家20名空軍把藥水和炮彈融合，施行全球降雨，整整下了三天，空氣中的都是藥水的氣味

電視劇裡看歷史

1999年的保密協議，最初爆發於2013年的一則微博。說的是1999年初，由於隕石撞擊地球，帶來了外星人對地球的侵略。最初襲擊的地點在各大洲都有，外星人利用阿姆斯特朗迴旋加速噴氣式阿姆斯特朗炮炮擊全球....戰爭最初由青年人、少年開始戰鬥，之後隨著事態發展，涉及人群範圍覆蓋到幾乎全年齡段，之後迅速引發成全球性戰爭。地球的反侵略自衛反擊戰開始。

由於戰爭非常慘烈，各個地區，各個國家都在用不同的方式方法進行著，抵抗外星侵略的戰爭。非常多的70後，80後為保衛地球家園進行殊死搏鬥。與此同時，宇宙中其他的一些正義聯盟也派部隊幫助地球人抵禦外侵。戰爭從1999年初一直持續到1999年冬，雙方都打的筋疲力盡，外來入侵者被迫與地球人及外來幫忙同盟簽訂了，《世紀末互不侵略星系同盟協定》。至此，地球人在付出了將近三分之一資源，數以萬計生命的代價下，得以保住地球。

戰後，當時的地球戰時最高指揮部同各地區指揮分部召開了一個戰後重建協議，協議中有一條：要對全世界的人民進行記憶消除（包括部分高層），但僅保留部分參與戰爭戰役人士和具有貢獻的人的記憶。並讓保留記憶的人簽訂了國際統一協定，承諾將永遠不再將此戰爭的任何事情以任何一種方式透露、洩露，否則會有“保留國際戰役最高組織”的人來採取相應措施。

這就是，1999年保密協議的大致內容及出處，至於1999年究竟有沒有這事，誰也不知道，也說不清。不過，大多數人認為是沒有的。