11月16日，顏曉元和日本農研機構（NARO）學者秋山博子聯名在PNAS上發表短文，指出他們認為上述論文存在的不當之處。論文第一作者及通訊作者，來自美國環保協會（Environmental Defense Fund，EDF）的學者Kritee也同期撰文回應。
“包括中國和印度在內，沒有一個主要的稻米生產國在其向聯合國正式提交的溫室氣體排放清單中報告了稻田排放的N2O或相關排放係數。”Kritee在論文中寫道，她認為這些國家在水稻種植策略中片面關注甲烷減排，卻忽略了另一種溫室氣體——一氧化二氮（N2O）。
對此，顏曉元等人認為，根據政府間氣候變化專門委員會（IPCC）的國家溫室氣體排放清單指南，水稻排放的N2O歸入了農業土壤類別，而不是水稻種植類別。世界上主要的水稻生產國，比如中國、印度和印度尼西亞，在其提交的排放清單裡都包括了這部分排放。事實上，關於間歇灌溉對稻田N2O排放的影響，從上世紀90年代以來就受到關注，已有大量研究，結果也體現到了IPCC的排放清單指南里了，不存在忽略的問題。
令顏曉元感到無法理解的，是Kritee等人對實驗數據的呈現和表述方式。論文在摘要中便寫道：“來自印度3個農業生態區的5個間歇性灌溉稻田的數據表明，N2O的排放量能達到每季每公頃33kg，比此前報告的最高數據高出三倍。”
“間歇性灌溉的研究我們也做過，並沒有發現這麼大的N2O排放量。”顏曉元說，“我仔細查閱了這個異常之高的數據（每季每公頃33kg）是怎麼來的，發現這是其提到的5個實驗點中，一個點的三次重複中的最高值。做實驗之所以要設置重複，就是因為一次實驗偶然性太大，沒有代表性，要取多次實驗的平均值。在摘要中直接拿一個異常高值說事，而不提處理的平均值，這在科技論文中是十分罕見的。”
顏曉元認為Kritee等人不僅誇大了稻田N2O的排放量，也誇大了減排潛力，有誤導作用。論文中提出的“通過對水、氮和碳的共同管理，水稻種植的淨氣候影響可以減少90%”，根本不可能實現。
“首先，這個結論是跟一個虛高的對照處理相比得出的；其次，其文章中減排的處理因為大量減少了氮肥用量，水稻產量平均減少了24%，最高的減少了44%，是不可能被接受的。”顏曉元說。
Kritee的論文於9月下旬在線發表後，吸引了中外媒體的報道，也曾引起政府機構的關注。日本農林水產省的官員就曾向秋山博子詢問此事。
此前，《中國科學報》記者也就此事向Kritee本人詢問，得到的答覆是她會在PNAS上做出回應。
在目前看到的回應文章中，Kritee表示堅持自己的相關表述，並聲稱“我們並不是說在任何地方都可以實現90%的減排，只是說這是我們研究中觀察到的最大的減排。”回應並未就數據呈現這一問題做出更多解釋。
相關論文鏈接：
初始論文：www.pnas.org/cgi/doi/10.1073/pnas.1809276115
顏曉元和秋山博子的評論文章：www.pnas.org/cgi/doi/10.1073/pnas.1816208115
Kritee等人的回應文章：www.pnas.org/cgi/doi/10.1073/pnas.1816677115
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