馬雲大戰雅虎
雅虎入局後，2007年11月6日，阿里巴巴B2B公司在香港上市，當天阿里巴巴B2B上市IPO就創造了兩個記錄：一是自2004年Google以後全球最大的高科技公司IPO融資---16.9億美元（2004年穀歌為16.66億美元）二是中國市值最高的企業，248億美元，相當於當時新浪、搜狐、網易以及攜程的市值總和。
雅虎和軟銀也因此是賺的盆滿缽滿，孫正義睡覺都能笑醒。阿里巴巴、雅虎、軟銀三家攜手共進，甜甜蜜蜜。但是幸福來的快，去的也快。這段甜蜜時光沒過多久，就迎來了危機。
2009年1月，由於雅虎的業績與華爾街的期望值相差太遠，楊致遠被迫辭去雅虎CEO的職位，由卡爾羅巴茲接任，而楊致遠依舊作為雅虎代表出任阿里巴巴董事。
蜜月期的結束，矛盾的開始
卡爾羅巴茲上任後，馬雲帶著管理層到美國拜訪他，對於前來拜訪的馬雲，卡爾羅巴茲並沒有熱情接待，反而將馬雲和他的團隊狠狠指責了一番，稱馬雲沒有把中國雅虎做好損害了雅虎的品牌利益。在外界看來，淘寶和支付寶都是阿里巴巴的親兒子，而雅虎中國只不過是中途認領的乾兒子，馬雲肯定把重心都放在自己親兒子身上，自然乾兒子的業務會日趨下降。而這一次的拜訪，成為了馬雲與卡爾羅巴茲甚至是和雅虎交惡的開端。馬雲開始思索回購雅虎的股權，意在和雅虎分手，穩穩地掌控阿里。
以前楊致遠在任的時候，同是華人，無論文化背景還是溝通方面都會比較順暢，同時楊致遠也履行承諾，不干擾阿里巴巴的運營，並且和孫正義對外一直是支持稱讚馬雲的。但是，楊致遠的下任，一切都隨之改變，離當初協議簽訂的終止時間2010年10月越來越近，屆時雅虎將獲得兩席董事會席位與馬雲團隊持平，並且投票權迴歸40%，遠高於馬雲團隊的31%，那麼無論是投票權還是董事會席位，馬雲團隊都處於劣勢。這樣一來馬雲的控制權就岌岌可危了。
然而，隨著2010年10月的到來，雅虎並沒有按照協議執行自己的權益增發董事會席位。卡羅爾巴茲深刻的意識到，馬雲作為阿里巴巴的絕對精神領袖，他的地位是不可撼動的，如果他按照協議增發董事會協議是合情合理，但是可一定會遭遇馬雲的不配合，甚至會導致股價下跌，所以他選擇溫和的表示支持馬雲團隊。
但是，事情並沒有這般順利，雖然在董事會席位一事上並沒有衝突的雙方在2011年5月爆發了戰爭。
雅虎的突襲
2011年5月10日，雅虎發佈了一個震驚華爾街的公告，公告聲稱馬雲沒有經過董事會的同意擅自將阿里巴巴集團下的支付寶轉移到馬雲和阿里巴巴創始人之一的謝世煌名下的“浙江阿里巴巴電子商務公司”。控訴馬雲違背了公司治理規則。緊接著5月13日，雅虎再次向《華爾街日報》等美國主流媒體爆料稱，支付寶的轉移價格為3.3億元人民幣，其中2009年6月轉移了70%股權，2010年8月轉移了剩下的30%。
這兩次的消息一出，美國的媒體炸開了鍋，紛紛抨擊馬雲違背契約精神，“竊取”了支付寶。雅虎的這一攻擊打的馬雲搓手不及。而這件事情要追溯到2010年。
2010年6月，中國人民銀行出臺了《非金融企業支付服務管理辦法》，規定從事第三方支付的企業必須向央行申請許可證，並且申請者必須是“境內依法設立的有限責任公司或股份有限公司”，而有外資成分的企業就得按照“中國人民銀行另行規定，向國務院報批”申請。而當時並沒有另行規定出臺，也就是說，外資企業沒辦法得到許可證。為了得到這個許可證，馬雲只好轉移支付寶到內資企業。
雙方交戰，豬隊友的神助攻
此前馬雲為了回購雅虎的股權多次和雅虎發生矛盾衝突，但是沒想到這一次，雅虎是動真格的了。於是面對雅虎的發難，5月14日，馬雲隨即在香港召開的阿里巴巴B2B公司股東大會上對外宣稱支付寶的轉移百分百透明合法，並且雅虎是知情的。但是在6月2日赴美參加第九屆數字大會期間又宣稱支付寶轉移是在告知股東後，不可置否的情況下由管理層單方面執行的。馬雲的前後矛盾，更是把自己向“竊取”的深淵推近一步。
6月12日，知名傳媒人胡舒立寫了一篇《馬雲為什麼錯了》的文章，將事情推向了高潮，輿論媒體紛紛質疑馬雲，馬雲處於極其不利的位置，先發制人的雅虎佔據了上風，而此時，作為馬雲的好朋友史玉柱發微博力挺馬雲，本想著幫馬雲一把，但是，不怕神一樣的對手就怕豬一樣的隊友，史玉柱搬出愛國理論，試圖打愛國情懷來獲得輿論的支持，但是，這不但沒有幫到馬雲，甚至是火上澆油。用愛國情懷來當違背契約的擋箭牌，在外界看來馬雲“竊取”是板上釘釘的事情。討伐馬雲的聲音是震天動地。
馬雲的反擊
面對如潮水般湧來的“倒馬”聲音，馬雲再也無法淡定了，於是6月14日，從美國回來的馬雲立馬召開媒體溝通會，在長達三個小時的會議中，馬雲向媒體講述了整件事情的來龍去脈。
一、在央行要決定監督第三方支付的時候，很長時間政策都不明確，所以阿里巴巴每次召開董事會都會討論支付寶的去留問題，並且在2009年7月24日，阿里巴巴的董事會授權給管理層，將支付寶轉為內資企業，以便取得許可證，這一點董事會的紀要可以證明。
阿里巴巴有一個傳統就是每次開董事會都會拍視頻留存為日後翻閱回憶用，所以馬雲第一次在湖畔花園宣佈成立阿里巴巴的演講至今還保存。
二、支付寶轉移到的“浙江阿里巴巴電子商務公司”依舊通過協議控制，被阿里巴巴集團掌控。形成表面內資，實則外資的的結構。同時3.3億元只是協議控制流程的一部分，並不是雅虎所說的低價竊取支付寶。
三、2011年第一季度，在發放第三方支付許可證的前夕，央行向所有申請者詢問是否有外資控股參與（包括協議控股）如果有，必須申報，如果沒有，則需做書面聲明加蓋公章。再加上馬雲曾在董事會上提出終止協議控股，但是軟銀和雅虎都不同意，馬雲堅持要按法律辦事，但是軟銀和雅虎主張避開中國法律。所以為了確保拿到許可證，馬雲在申報前夕單方面終止協議控制，並在第二天告知董事會，並提出談判補償。
至此，事情的真相漸漸浮出水面，馬雲和雅虎多次衝突矛盾，馬雲一直意在回購雅虎的阿里巴巴股權。但是作為日薄西山的雅虎，阿里巴巴是他最有價值的一塊資產，他怎麼能輕易放手，就算馬雲提出回購，只要他提出高價讓馬雲知難而退，他依舊可以掌握阿里的大股權。但是支付寶作為阿里巴巴最有含金量的一塊，脫離了阿里巴巴就讓這件事情發生了變化。
對於雅虎，支付寶留在阿里巴巴可以保證他所佔股權的含金量同時對於日後馬雲回購也擁有更多的主動權，但是支付寶被馬雲強制脫離阿里巴巴，使雅虎失去主動權和謀求更大權益的籌碼，只能面對被動接受馬雲補償的局面，並且現在補償還是馬雲說了算。於是為了扭轉不利於自己的局面，他以先發制人，向馬雲發起輿論攻擊，避開自己試圖繞開中國法律辦理許可證將輿論帶向馬雲竊取支付寶。通過激起美國媒體的憤怒，通過媒體向美國政府施壓，再由美國政府向中國政府施壓，這樣兩個企業的事情就上升到兩個國家的事情，企圖以此來扭轉對自己不利的局面。
最後的談判
但是隨著事情的真相浮出水面，雅虎的陰謀也敗露，最終，阿里巴巴（馬雲）、雅虎、軟銀不得不回到談判桌上。最終三方達成補償協議，直到支付寶上市之前，支付寶公司每年都要向阿里巴巴繳付當年稅前淨利潤的49.9%作為知識產權費，而支付寶上市後，支付寶要向阿里巴巴支付上市IPO市值的37.5%。
至此支付寶事件畫上了句號。
2012年5月20日，一直徘徊在談判桌上的阿里巴巴和雅虎最終達成回購協議，阿里巴巴以現金63億美元以及不超過8億美元的阿里巴巴新增的優先股，換購雅虎所佔阿里巴巴集團的20%股權，佔雅虎所持阿里巴巴股權的一般。至此，馬雲終於可以高枕無憂了。
馬雲作為阿里巴巴的絕對精神領袖，其地位是無可撼動的，雅虎和軟銀都深知這一點。這也是為什麼阿里巴巴始終沒有被資本所左右的原因。但是，對於阿里巴巴三足鼎立的股權架構，馬雲始終是不放心的，這也是馬雲回購雅虎股權的原因。馬雲與新浪王志東相比，他在企業擁有絕對的精神指引地位，被譽為阿里之神，而王志東的失敗是他不能得到下屬甚至整個企業的認可所造成的。所以馬雲掌控阿里靠的不是股權，而是馬雲的人格魅力以及把自己塑造成阿里的靈魂人物。所以對於企業家創始人，依靠股權掌控企業固然重要，但是，自己在企業的精神領袖地位也是非常重要的。
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