影片《鼠来宝》由三只花栗鼠一边往树洞里装冬天的粮食松果一边欢乐的唱歌作为影片开头。交代出了主人公三只花栗鼠会唱歌的特点。随后镜头一转回到人类主人公代维的家中。代维又一次匆忙的起床并且大喊要迟到了，可见代维的人物形象是一位对自己本工作不感兴趣的人。又从代维家中的家具摆放来看，代维是一位音乐的狂热者。镜头跟随代维来到唱片公司，从公司内职员对待代维的态度来看，代维并不是一个受欢迎的人。但作为老同学的唱片公司老板伊恩因为面子不得不接待代维。代维跟着伊恩来到伊恩的办公室，向尹恩展示自己的创作新曲，然而伊恩并不买账，对代维说他创作的歌曲并不能符合现在大众的审美。
与此同时，森林里的三只花栗鼠们，因为所住的松树被砍下来作为尹恩公司圣诞节的装饰树，误打误撞的来到人类居住的城市。而被伊恩拒绝的代维生气的向秘书们要起刚刚和伊恩老板进办公室时秘书们准备的吃的。但是秘书们见伊恩并不能讨的老板的欢心，于是全部都拒绝代维的要求。生气的代维将一果篮吃的带回家中。巧合的是三只花栗鼠就躲藏在果篮中跟随代维一起回到了代维的家中。
当来到代维的家中，三只花栗鼠们显得无比兴奋。发现了家中居然有那么多好吃的激动不已，于是开启了翻箱倒柜的模式。这动静惊动了还在生气中的代维，代维小心翼翼的搜寻着这动静的来源，然而并没有收获。代维以为是可恶的老鼠在作怪，于是代维开始乱敲乱打，把家中弄得一片狼藉。终于发现了三只小花栗鼠。代维要将花栗鼠赶出去，因为它们把代维的家中弄的一片狼藉，三只可怜的小花栗鼠被代维赶出了门外，并且代维把窗帘顺带拉上，屋外渐渐下起了雨，小花栗鼠们在天气的衬托下显得更可怜了。
三只花栗鼠在门外悲伤的唱起了歌。代维被歌声吸引，他惊讶的说不出话来，代维不敢相信花栗鼠居然可以讲人话，而且唱歌居然那么好听。
代维将花栗鼠们带回家中，问它们为什么会唱歌。花栗鼠说那不是唱歌，于是它们三只合作唱了一首真正的歌，让代维更惊喜不已。三只花栗鼠分别向代维介绍了自己，调皮的艾尔文、可爱的喜多以及聪明的西蒙。代维看天色已经不早了，于是他将三只花栗鼠安顿好，准备睡觉。进入睡梦中的小花栗鼠们哼起了几个简单的音符，这给躺在床上还没睡着的代维极大的创作灵感。代维从床上翻起来，连夜创作了一首歌。
第二天一早，代维就拿着新歌让三只花栗鼠们演唱，他们配合的非常好，代维觉得这回他终于可以咸鱼大翻身了。于是代维欣喜的带着三只小花栗鼠去往伊恩的公司。当伊恩不耐烦的将代维带进自己的办公室，代维迫不及待的告诉伊恩这三只会唱歌的小花栗鼠，伊恩觉得代维已经疯了。代维看伊恩不相信他，于是把装花栗鼠们的箱子打开，但是小花栗鼠们并没有如约演唱，任凭代维如何引导它们，但是都没有成功。无奈之下，代维只能把花栗鼠们又带回了家。
与此同时，代维上班又一次迟到了，在代维向顾主们讲解这次合同的创意时，却发现他的资料全部被小花栗鼠们画上了图画。因为这件事，代维失去了他的工作，没有了经济来源。回到家中的代维，生气的又要把花栗鼠们赶出去，花栗鼠们知道这次犯了大错，于是想要将功补过，提醒代维与前女友的约会时间快要到了，而它们三个可以帮助他把一片狼藉的屋子收拾的干干净净，情急之下代维只能选择再相信花栗鼠们一次。
于是代维去订购了晚餐，回到家中，果然被收拾的仅仅有条。但是在代维和前女友约会的时候，花栗鼠又开始了“捣蛋”想通过一己之力帮助代维和前女友重归于好。谁知道反而越帮越忙，代维向前女友解释道这是三只会将人话的花栗鼠，前女友失望又生气的甩门而去。代维生气的回到屋中，写下纸条，想要告诉花栗鼠们这个地方不适合他们的生存。可最终并没有把纸条给他们，而是扔了纸条。
三只花栗鼠偷偷跑到老板伊恩的家中，唱完了代维创作的新歌曲，伊恩惊讶的同时，觉得自己的商机又来临了。第二天，代维带领三只小花栗鼠逛超市时，面对喜欢的食物，代维制止的告诉他们，已经没有钱买这么贵的零食了。与此同时，超市响起了代维创作的新曲。三只小花栗鼠由此火的一塌糊涂。
然而老板伊恩只顾祖赚钱，这与代维的想法完全不一致。于是尹恩从中作梗，使花栗鼠误会了代维，于是离开了代维，住到了尹恩的家中。而伊恩完全只想着赚钱，不顾及三只小花栗鼠是否能够承受如此频繁的表演，花栗鼠们嗓子沙哑，尹恩要求它们假唱。代维看见新闻上对小花栗鼠们的报道，觉得自己应该把它们再带回来，于是打电话给伊恩，然而伊恩完全无视代维的请求，反而告诉安保不可以让代维靠近演唱会。
代维千辛万苦，通过前女友的帮忙，潜入了演唱会，但被安保发现。就在代维要被驱赶出去的时候，喜多听见了代维的呼喊。于是假唱事件被发现。但三只小花栗鼠被伊恩抓了起来。正当代维开车追赶尹恩时，三只小花栗鼠从后座跑了出来，原来它们早就从笼子里跳了出来。发现花栗鼠们被掉包的伊恩生气的大叫。
这部影片将真人与三维动画相结合，打造出了人类与动物同一空间交流的场面，幽默的剧情以及丰富的人物形象，为这部影片的成功奠定了坚实的基础。
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