近年來，全球大量基因組測序項目開展得如火如荼，例如Personal Genomes Project等國際項目、100K Genomes Project等地區或國家項目，以及針對某類疾病的基因組項目，例如TCGA等。目前，這些項目多由政府機構、基因測序企業和研究機構發起，鮮有高校主導的大型基因測序計劃。
日前，美國耶魯大學計劃於2019年開啟一項全新的大型基因組醫學測序項目，至少招募10萬名患者進行基因組測序，並對其基因組數據和電子健康記錄數據進行分析，為科學研究和臨床可行性結果提供支持。耶魯大學希望，該計劃能為學術健康中心的研究人員建立一種範例和模式，併成為未來相關研究項目的藍圖。
該計劃由耶魯大學醫學院與耶魯紐黑文衛生系統共同發起，計劃尚未正式命名。10萬人規模只是最初設定目標，隨著計劃的進行，這一數字有可能會增加。對於這一數字，耶魯大學表示，達到10萬人規模將有機會與其他大型生物樣本庫進行合作，以進行更多的深入研究。目前，耶魯大學醫學院和耶魯紐黑文衛生系統正在積極籌集計劃的啟動資金，並已得到美國康涅狄格州政府提供的資助。據悉，相關機構已經投入了2000多萬美元。計劃啟動後，組織者還將繼續尋找其他資金投入，包括研究補助資金以及與工業界和學術界的合作投入。
按照計劃，研究團隊在2018年將主要進行Pipeline創建，以便對大規模數據數據進行處理。從2019年1月開始，該項目將每週招募400至500名患者，或每年招募20,000至25,000名患者，並逐步建立外周血生物樣本庫。此外，參與者將通過耶魯紐黑文健康醫院網絡在整個康涅狄格州招募，包括耶魯紐黑文醫院、布里奇波特醫院、格林威治醫院等。同時，這些醫院也被授權對生物樣本進行研究，並反饋有助於患者醫療保健的基因組信息。
該計劃將至少對參與者進行外顯子測序，並獲取基於微陣列的基因分型數據。計劃將重點關注增加單基因疾病風險的罕見變異，涉及常見疾病的多基因評分和藥物基因組學變異等。整個項目可能會分階段進行，但這三項將是首要任務。耶魯大學方面表示，雖然希望能夠使用全基因組測序，但由於涉及到成本問題，最終選擇先進行外顯子測序。
Michael Murray博士，圖片來源：Yale School of Medicine
據悉，該計劃由耶魯大學醫學院Michael Murray博士領導。2018年之前，Murray曾擔任Geisinger健康系統任臨床基因組學主任，並密切參與了MyCode社區健康計劃。MyCode社區健康計劃於2007年啟動，是首批向參與者反饋臨床可行性結果的大型基因組醫學計劃之一，旨在將生物樣本和患者電子健康記錄的數據進行系統性整合，構成具有更廣泛應用價值的研究資源，創建了一種新的、有利於轉化醫學研究的資源構建模式。Murray表示：“耶魯大學的這項計劃將以Geisinger已有模型作為模板，並吸取此前的經驗教訓，迅速建立一個大型生物庫。”
但耶魯大學計劃與MyCode社區健康計劃也有著顯著的不同。從計劃發起方考慮，MyCode社區健康計劃主要涉及醫院系統，耶魯大學的這項計劃將由醫院、醫科院校和綜合性大學共同參與。此外，在參與者組成方面，耶魯大學將主要從美國康涅狄格州招募。該地區人口總數約360萬，與其他州相比人口相對較少，但是其種族構成與美國基本相當，因此可獲得多樣化的基因組隊列數據，這與幾乎完全基於歐洲血統的MyCode社區健康計劃不同。Murray認為，該計劃有助於相關基因研究和其他精準醫學計劃的進行，或將成為整個國家的優秀試點。
另外一點不同就是，MyCode社區健康計劃將測序工作外包給其合作伙伴，而耶魯計劃的測序工作將在耶魯基因組分析中心（YCGA）實驗室進行。該中心實驗室已獲得CLIA認證，實驗室出具的檢測報告和結果數據將獲得美國醫療保險、醫療救助機構及FDA的認可。此外，新計劃還擁有一個有著豐富的臨床基因組學和大型研究計劃工作經驗的團隊，他們將全程參與測序工作，並將這些結果上傳到患者的電子健康記錄中。
耶魯基因組分析中心測序平臺，圖片來源：YCGA
耶魯大學希望，該計劃能為參與者提供有助於他們疾病預防和治療的信息。事實上，這種生物庫的建立和相關信息篩查確實會讓人們意識到一些重大的健康風險，例如心臟病和癌症的風險，並進行合理干預。Murray表示，大型基因測序計劃需要一段時間來獲得長期研究結果，但這些數據這會以非常具體的方式使人們受益。目前，該計劃正在進行緊張的準備工作，相關網站預計將在未來幾個月內上線。
值得關注是，如今除了典型的醫學和基礎科研工作者外，越來越多領域的研究者有願意參與到生物庫的相關研究中。例如，耶魯大學的社會科學家已經表達了對該計劃的興趣。此外，項目中進行中，反饋和管理基因數據還會涉及健康經濟學、道德和法律問題，這可能是公共衛生、法學或商學領域學者所關注的。
1. Yale to Launch Large-Scale Genomic Medicine Project
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