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芹菜死棵爛根一般都是由真菌引起，引起的原因大都是土地長時間使用，沒有進行過消毒處理，重茬嚴重引起，造成爛根的病主要有枯萎病、根腐病、灰黴病、黑腐病等。
1.枯萎病感染後，生長緩慢，嚴重時萎蔫枯死，葉柄變為紅色，根系腐爛，最後整株死亡。防治：發病初期可採用70%甲基託布菌可溼性粉劑1000倍液或50%萎菌淨可溼性粉劑800倍液噴施，連噴三次。
2.根腐病主要危害根部和莖基部，被害部位感染紅褐色病斑，後變為暗褐色或黑褐色，由下往上發展，主根被害腐爛或壞死，容易拔出病株。防治：實行輪作，育苗時要進行土壤消毒，以防從苗期感染。發病初期可用50%多菌靈可溼性粉劑500倍液或30%綠得寶懸乳劑600倍等藥灌根，7天一次。
3.灰黴病幼苗多從根莖部發病，呈水漬狀病斑，表面生灰色黴層，嚴重時芹菜整株腐爛死亡。防治：加強通風排溼，降低溼度。發病初期可用50%利黴康可溼性粉劑1000倍液或50%速克靈可溼性粉1500倍液噴施7天一次連噴3次。
4.黑腐病主要危害根莖部和葉基部，多在接近地面部位感染，侵染後受害部位變為灰褐色，初期病部表皮完好，後期葉子下垂，呈枯萎狀，病部生出小黑點，即分生孢子器。防治：發病初期噴灑30%綠得寶懸浮劑400倍液，或54%冠菌銅幹懸浮劑1000倍液噴施，7天一次連噴3次。
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經過我檢索相關資料，並結合個人經驗，特輯成此文供參考。其一，立枯病，苗期發生死苗，病苗根部變成紅褐色，多是立枯絲核菌侵染引起。防治藥劑可選擇福美雙、井岡黴素、惡黴靈等。其二，黃萎病，苗期染病後生長變慢，葉色變黃，幼苗萎蔫枯死。成株可見病莖維管束變褐，根系腐爛。防治藥劑可選用甲基立枯磷、甲基託布津等藥劑灌根。其三，黑腐病，染病後受害部先變灰褐色，之後變黑腐爛。防治藥劑可選用靠山(氧化亞銅)、苯菌靈等。其四，灰黴病，一般多從植株有結露的心葉或下部有傷葉片開始發病，病部軟化腐爛，長出灰色黴層，防治藥劑可選撲海因、多黴威等。其五，菌核病，受害處初呈褐色水浸狀，溼度大時形成軟腐，表面生白色菌絲，後彩成鼠糞狀黑色菌核。防治藥劑可選撲海因、農利靈、甲基託布津等。其六，軟腐病，先出現水浸狀、淡褐色凹陷斑，後呈溼腐狀，變黑髮具，是細菌性病害。防治藥劑可選農用鏈黴素、新植黴素、可殺得(氫氧化銅)等。也可用醫用高錳酸鉀1000倍液。個人經驗挺好的。圖1為菌核病，圖2為軟腐病，圖3為黑腐病。
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芹菜死棵爛根現象都比較普遍。死棵前秧苗萎蔫，莖基部腐爛或根部腐爛，究其原因是真菌或細菌感染所致，真菌像立枯病菌，細菌性軟腐病菌等。
想要徹底杜絕死棵爛根還需要下點功夫。首先就是克服重茬栽培障礙，進行土壤消毒，用甲基託布津撒施在栽植壟裡摟勻，栽植時用普力克正常濃度浸根。定植後第一水時隨水衝施一遍氫氧化銅或多寧用來殺滅病原菌，澆水不宜過大，正常生長後多衝施有機肥來改良土壤，增加土壤通透性，在結合衝施氮磷鉀肥，這樣就基本保證正常生產了。
