2015年，南京中醫藥大學首次招收“4+5本博連讀”中醫學專業。今年，南中醫又發揮中藥學A+學科優勢，推出“4+5本博連讀”中藥學專業。
2015年，南京中醫藥大學首次開設中醫學本博連讀9年制新模式，實行“4+4+1”制培養模式。其中，前四年以課程學習為主；後四年進入臨床各科輪轉學習,最後一學年要完成專科化的學習，學生可以跟隨國家級的名醫、名師進行專科化的師承學習，並將赴海外名校研習，進行專題研究，最後完成博士學位論文答辯。
2018年，南京中醫藥大學與中國科學院藥物研究所簽約合作共建“新中藥學院”，今年首推“4+5本博連讀一體化”培養模式，計劃招生30人。採用長學期與短學期相結合的方式，打破學科壁壘，臨床應用與現代藥學研究結合。以中國科學院藥物研究所一流的師資隊伍和雄厚的科研實力為基礎，本科階段“一對一”配備導師,以“新中藥學院”“康緣中藥學院”等院系為平臺，與相關院所、企業合作承擔重大研究項目，培養學貫中西、具有國際競爭力的卓越科學家。
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