電子支付是實現完全電子商務的關鍵的一環。目前，通行的電子支付工具主要有電子現金、信用卡、電子錢包和電子支票這些方式。
①電子現金。
電子現金(E-cash)即數字現金，是一種以數據形式流通的貨幣。用戶用現金或存款申請兌換E-cash現金，銀行把現金數值轉換成為一系列的加密序列數。用戶用授權的E-cash現金進行支付，電子現金便通過網絡轉移到商家，商家聯機向E-cash銀行驗證真偽;商家將收到的E-cash現金向銀行申請兌付，E-cash銀行收回E-cash現金，保留其序列號，再將等值的貨幣存入商家的銀行賬戶。電子現金具有多用途、使用靈活、匿名性、快速簡便的特點，無需直接與銀行連接便可使用，適用於小額交易。
②信用卡。
信用卡是種主要的、使用最廣泛的銀行卡。信用卡不僅是一種支付工具，同時也是一種信用工具。使用信用卡可以透支消費，給用戶帶來了方便。目前，信用卡的支付主要有四種類型:無安全措施的信用卡支付、通過第三方代理人的支付、簡單信用卡加密和SET信用卡方式。
③電子支票。
電子支票和傳統的支票形式幾乎有著同樣的功能。不同在於傳統的支票人為簽名，而電子支票需要經過數字簽名，使用數字憑證確認支付者、被支付者身份、支付銀行和賬戶。從偽造簽名的意義上說，偽造一個電子支票遠比偽造一個傳統的支票的簽名難度大，所以在安全度上電子支票比較高。
④電子錢包。
電子錢包是智能卡在電子商務中的應用。所謂的智能卡是在塑料卡上安裝嵌入式微型控制器芯片的IC卡。電子錢包完全擺脫了實物形態，購物方式十分省時、省事、省力;而且，對於顧客來說，整個購物過程自始至終都是十分安全可靠的。在購物過程中，顧客可以用任何一種瀏覽器進行瀏覽和查看。由於顧客的卡上信息別人看不見，因此保密性很好，用起來十分安全可靠。另外，有了電子商務服務器的安全保密措施，可以保證顧客去購物的商店是真實可信的，從而保證顧客安全可靠地買到貨物。
⑤移動支付。
目前，手機在國內越來越普及，並且利用手機進行無線付費已成為可能。手機可以代替各種銀行卡成為個人的隨身電子錢包。手機支付方式不僅快捷，而且實現方便，所以用手機消費會逐漸成為用戶和商家方便的選擇。目前主要通過手機進行一些小額付費業務，主要有:電話費/網費付費業務、電話卡付費業務、月雜費付費服務、證券交易服務。
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