經中央全面深化改革領導委員會第二次會議審議通過，8月3日，國務院公佈了《關於改革完善醫療衛生行業綜合監管制度的指導意見》。《指導意見》提出，到2020年，建立職責明確、分工協作、科學有效的綜合監管制度，健全機構自治、行業自律、政府監管、社會監督相結合的多元化綜合監管體系，形成專業高效、統一規範、文明公正的衛生健康執法監督隊伍，實現醫療衛生行業綜合監管法治化、規範化、常態化。
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《指導意見》提出，轉變監管理念、體制和方式，從重點監管公立醫療衛生機構轉向全行業監管，從注重事前審批轉向注重事中事後全流程監管，從單項監管轉向綜合協同監管，從主要運用行政手段轉向統籌運用行政、法律、經濟和信息等多種手段，提高監管能力和水平，為實施健康中國戰略、全方位全週期保障人民健康提供有力支撐。
《指導意見》明確，合理界定並落實政府辦醫職責和醫療衛生機構自主運營管理權限，明確醫療衛生監管責任。積極探索公立醫院管辦分開的有效實現形式，明確政府及相關部門的管理權力和職責，構建決策、執行、監督相互分工、相互制衡的權力運行機制。所有醫療衛生機構不論所有制、投資主體、隸屬關係和經營性質，均由所在地政府衛生健康行政部門（含中醫藥管理部門，下同）實行統一監管。
《指導意見》明確，堅持和加強黨的全面領導，不斷完善醫療衛生行業黨建工作領導體制和工作機制。強化政府主導責任，深入推進“放管服”改革，充分發揮政府在法治建設、行業規劃、標準制定、行業准入、行政執法等方面的主導作用。按照精簡、統一、效能的原則，整合集中醫療衛生行業監管職能和責任。在不單設實體性辦事機構、不增加編制的前提下，依託現有資源，建立由衛生健康行政部門牽頭、有關部門參加的綜合監管協調機制，負責統籌綜合監管的協調、指導和醫療衛生服務重大案件查處等工作。制定完善部門權責清單，明確監管職責。依法承擔醫療衛生行業執法監督職責的機構開展相關執法監督工作。
《指導意見》對落實醫療衛生機構自我管理主體責任、發揮行業組織自律作用、加強社會監督提出了具體要求，並以附件的形式明確了重點任務分工和部門職責分工。
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