掃描儀的接口是指與電腦主機的連接方式，通常分為SCSI、EPP、USB三種，後兩種是近幾年才開始使用的新型接口。
傳統的掃描儀都使用SCSI卡作為接口，SCSI接口速度快、連接設備多而且系統資源佔用率低。
EPP並口掃描儀使用普通並行線即可與電腦相連接，EPP並口的優勢在於安裝簡便、價格相對低廉，而且不需要設置中斷、地址等，不會與其他硬件發生衝突，弱點就是比SCSI接口傳輸速度稍慢，當然比普通並口的速度要快很多。
USB接口速度更快（USB接口最高傳輸速率2Mbps），使用更方便（支持熱插拔），它的缺點與其他USB設備一樣，因為沒有USB在DOS環境的驅動程序，所以不支持DOS系統。
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