我们都知道，这次事件的由头与冯小刚、刘震云有关，在范冰冰与冯小刚早年合作的电影《手机》中，葛优扮演的的男主角疑似影射了主持人崔永元，电影中的该角色出轨劈腿，最后自食其果的故事，极大影响了崔永元的事业和职业上升。
刘震云，是《手机1》的著作人，尤其是原本打算邀请崔永元出演，崔老师拒绝后，还用心去帮助他们出主意，结果电影出来，剧中影射到崔老师的角色是因为出轨下属而离职。后来刘震云是跟他道歉了三次，事也就这样过去了。《手机2》出来之前崔问过刘希望三思，刘说不会，名字叫《朋友圈》，但海报出来还是《手机2》，崔彻底怒了。
崔永元爆料央视一位主持人在采访完某艺术家后，骂其“这傻×今天真配合”。2005年，崔永元在一次接受采访时说：“我们台一个主持 人在做谈话节目，采访一位艺术家，这个艺术家很投入，很忘情，主持人也在现场号召大家向他学习。 这个主持人出来后却说‘这傻×今天真配合’……我看这个节目时，他(那个主持人)在哭，我就呕吐。”当时他没有指出这名主持人是谁，公众猜测 该话影射朱军。后来向朱军及家人鞠躬致歉。
崔永元和方舟子两人因“转基因之争”开始辩论，随后上升到质疑对方语言逻辑问题、有无资格科普等。辩论升级为闹剧，方崔互相问候家人。随后双方都起诉对方。2015.海滨法院公开宣判：双方均构成名誉侵权，互赔4.5万元。相互道歉，删除侵权微博。
而因为和方舟子互怼，崔永元的朋友同时也是方舟子朋友司马南，因为支持方舟子而遭到崔永元的怒怼，崔永元频繁指责司马南“造谣”
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