为满足北京市中心至城市副中心早晚高峰通勤需求，京投公司旗下北京城市铁路投资发展有限公司积极发挥北京市郊铁路建设、运营平台的主体作用，在中国铁路北京局集团的大力支持下，通过调整北京西站与北京站地下直径线的运行时分，压缩北京站、北京东站停车时间等方法，自2018年7月1日起，将副中心线北京西站至通州站部分车次运行时间从48分钟压缩至39分钟，北京站至通州站运行时间由28分钟压缩至23分钟，进一步提升中心城区至城市副中心快捷通行能力。新列车时刻表自2018年7月1日起实行。
北京城市副中心线：全长29.6公里，设北京西、北京、北京东、通州4座车站。每日开行北京西（北京）站至通州站市郊列车4对，其中早间开行北京西（北京）站至通州站3列、通州站至北京西站1列；晚间开行通州站至北京西（北京）站3列、北京西站至通州站1列。
副中心线“京通号”采用CRH6A型城际动车组，具有运量大、速度快、快速乘降、运行平稳、节能环保的特点。为尊重市民出行习惯、注重市民出行体验，城市副中心线设置了实名制市郊铁路一卡通卡、中铁银通卡、铁路磁质客票三种票卡供市民选择，使用实名制一卡通乘车的乘客可享受累计优惠政策。
交通接驳上，目前北京西站、北京站周边地面公交及轨道交通网络比较完善，均可以满足市郊铁路乘客换乘需求。为方便市郊旅客快速乘降，城市副中心线在北京西站和北京站还设置了乘客专用通道，实现快进快出。
此外，“京通号”上还安装了车载PIS和WiFi系统，乘客可免费上网，并通过车载PIS系统收看新闻类节目信息。
其他运营线路：
除副中心线外，我市已运营的市郊铁路还有S2线和怀柔-密云线。
怀柔-密云线：线路起自黄土店站，终至古北口站。先期停靠黄土店、昌平北、怀柔北3座车站，长度79公里。黄土店站可与地铁霍营站换乘。
S2线：线路起自黄土店站，全长108.3公里，停靠黄土店、南口、八达岭、延庆、康庄、沙城6座车站。黄土店站可与地铁霍营站换乘。
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