在组织建设信息系统的过程中，往往以职能部门为单位建设信息系统，并且一般而言，首先建立面向事务处理的系统，然后在基础上再建立面向决策支持的系统。这些系统可能是独立建置的，彼此之间完全不相关，以至于不同的信息系统之间无法有效、流畅地沟通。这会导致什么问题呢?我们来看一下真实的企业是如何运作的。
层次、职能从静态的观点说明了组织的架构，而业务流程则从动态的视角阐明了组织的运行过程。所谓的业务流程，是指一系列逻辑上相关联的活动，它们反映出企业中具体的任务是如何执行的。订单履行、生产、采购等都是典型的业务流程，因此每一个企业都可以视为一系列业务流程的集合。更进一步而言，一个企业的效率就取决于其业务流程的设计与协调。虽然许多业务流程往往主要与某个特定的职能部门相关联，但是现实中更多的业务流程往往是跨越不同的部门，需要不同部门的分工与合作。
例如，对于一个顾客订单履行流程，首先，销售部门收到销售订单。该订单首先传递到财务部门，确认顾客可以通过信用赊账或者必须在发货前付款。一旦顾客的信用得到确认，生产部门将制订生产计划并生产商品。制造完成后，还需要通过物流部门或第三方把商品送给客户。最终，顾客不但会收到产品，而且在此前后还会收到告知其产品已经发出的发货通知和由财务部门提供的账单或发票。
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